RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.155e-7■■■■□ 21.5
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP4-202ENST00000392011 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 CASC1Q6TDU7 716 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 MS4A1P11836 297 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF3BO15066 747 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP4-202ENST00000392011 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RALBP1Q15311 655 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 JPH4Q96JJ6 628 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP4-202ENST00000392011 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4-202ENST00000392011 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCA4P51532 1647 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 NLRP13Q86W25 1043 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 APBB1O00213 710 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNJ4P48050 445 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-202ENST00000392011 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 FGD1P98174 961 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 HSCBQ8IWL3 235 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCB2Q00722 1185 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA2Q08379 1002 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 IGF1RP08069 1367 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-202ENST00000392011 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 PANK3Q9H999 370 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 NPHP1O15259 732 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 PDE3BQ13370 1112 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-202ENST00000392011 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM2FA1L443 756 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRGP23470 1445 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF15Q9NS87 1388 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.081e-8■■□□□ 14.2
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 MCCP23508 829 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 USP47Q96K76 1375 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4-202ENST00000392011 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 PLIN1O60240 522 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 STK31Q9BXU1 1019 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP44Q96MT7 982 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-202ENST00000392011 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4-202ENST00000392011 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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