RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377075.2

CNNM4-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM4, Length 4,800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-201ENST00000377075 MS4A1P11836 297 aa26.34■■□□□ 1.81
CNNM4-201ENST00000377075 CASC1Q6TDU7 716 aa26.34■■□□□ 1.81
CNNM4-201ENST00000377075 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CNNM4-201ENST00000377075 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CNNM4-201ENST00000377075 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CNNM4-201ENST00000377075 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CNNM4-201ENST00000377075 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
CNNM4-201ENST00000377075 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CNNM4-201ENST00000377075 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 NLRP13Q86W25 1043 aa26.25■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.25■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 A0A0G2JS52 829 aa26.25■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 HSCBQ8IWL3 235 aa26.24■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 GGT6Q6P531 493 aa26.23■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 KANK1Q14678 1352 aa26.22■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.21■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 STK26Q9P289 416 aa26.2■■□□□ 1.79
CNNM4-201ENST00000377075 SOX12O15370 315 aa26.2■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 PLCB2Q00722 1185 aa26.19■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.18■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.17■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 GOLGA2Q08379 1002 aa26.16■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.16■■□□□ 1.78
CNNM4-201ENST00000377075 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.13■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.13■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 PDE3BQ13370 1112 aa26.12■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.12■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 APBB1O00213 710 aa26.11■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 PLIN1O60240 522 aa26.09■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.09■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.08■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 SMARCA4P51532 1647 aa26.08■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.08■■□□□ 1.77
CNNM4-201ENST00000377075 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 MLECQ14165 292 aa26.07■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.07■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.07■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 PANK3Q9H999 370 aa26.04■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.04■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 KIF3BO15066 747 aa26.03■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 KIF15Q9NS87 1388 aa26.03■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 KCNJ4P48050 445 aa26.03■■□□□ 1.76
CNNM4-201ENST00000377075 PDE4AP27815 886 aa26.01■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.01■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 SLC4A3P48751 1232 aa25.99■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.98■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 IGF1RP08069 1367 aa25.98■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 USP47Q96K76 1375 aa25.97■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 FGD1P98174 961 aa25.97■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.97■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 JPH4Q96JJ6 628 aa25.96■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CNNM4-201ENST00000377075 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.95■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 CRBNQ96SW2 442 aa25.92■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.91■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.91■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 KIF21BO75037 1637 aa25.91■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.9■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 GBP4Q96PP9 640 aa25.9■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.89■■□□□ 1.74
CNNM4-201ENST00000377075 MCCP23508 829 aa25.88■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.87■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.86■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.86■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC7Q96M83 1385 aa25.83■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 APAF1O14727 1248 aa25.83■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.83■■□□□ 1.73
CNNM4-201ENST00000377075 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.83■■□□□ 1.72
CNNM4-201ENST00000377075 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
CNNM4-201ENST00000377075 FAM161AQ3B820 660 aa25.83■■□□□ 1.72
CNNM4-201ENST00000377075 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms