RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 NEO1Q92859 1461 aa40.21■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.2■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.19■■■■■ 4.02
GKAP1-202ENST00000376365 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.17■■■■■ 4.02
GKAP1-202ENST00000376365 KDM6BO15054 1643 aa40.14■■■■■ 4.02
GKAP1-202ENST00000376365 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
GKAP1-202ENST00000376365 AKNAQ7Z591 1439 aa40.11■■■■■ 4.01
GKAP1-202ENST00000376365 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 ADGRL1O94910 1474 aa40.04■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.01■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
GKAP1-202ENST00000376365 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
GKAP1-202ENST00000376365 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.95■■■■□ 3.99
GKAP1-202ENST00000376365 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC1P33527 1531 aa39.93■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.92■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 MIA2Q96PC5 1412 aa39.92■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 RAPGEF3O95398 923 aa39.88■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 RICTORQ6R327 1708 aa39.87■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.86■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.86■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.84■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.83■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.83■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.82■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.82■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.8■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.8■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.8■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.75■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 AFAP1Q8N556 730 aa39.74■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.71■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 KDM5CP41229 1560 aa39.7■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 MBD5Q9P267 1494 aa39.69■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.66■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.66■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.66■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.65■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.63■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.63■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
GKAP1-202ENST00000376365 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.59■■■■□ 3.93
GKAP1-202ENST00000376365 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.58■■■■□ 3.93
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.55■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 TSPY4P0CV99 314 aa39.55■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 TSPY10P0CW01 314 aa39.55■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.52■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 ATP7AQ04656 1500 aa39.51■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.51■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.49■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 DAPK1P53355 1430 aa39.48■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.47■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC5O15440 1437 aa39.47■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.45■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA6Q8N139 1617 aa39.44■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.43■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 ATP10AO60312 1499 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.34■■■■□ 3.89
GKAP1-202ENST00000376365 ITGAEP38570 1179 aa39.34■■■■□ 3.89
GKAP1-202ENST00000376365 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.31■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 PLXNC1O60486 1568 aa39.29■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 REREQ9P2R6 1566 aa39.29■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 A2MP01023 1474 aa39.26■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.25■■■■□ 3.87
GKAP1-202ENST00000376365 PTPRKQ15262 1439 aa39.22■■■■□ 3.87
GKAP1-202ENST00000376365 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.22■■■■□ 3.87
GKAP1-202ENST00000376365 ADGRL2O95490 1459 aa39.2■■■■□ 3.87
GKAP1-202ENST00000376365 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.19■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 KIF15Q9NS87 1388 aa39.19■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 NCOA1Q15788 1441 aa39.17■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 AGLP35573 1532 aa39.16■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.15■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 ROCK1Q13464 1354 aa39.13■■■■□ 3.85
GKAP1-202ENST00000376365 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.09■■■■□ 3.85
GKAP1-202ENST00000376365 MLECQ14165 292 aa39.08■■■■□ 3.85
GKAP1-202ENST00000376365 ERBINQ96RT1 1412 aa39.03■■■■□ 3.84
GKAP1-202ENST00000376365 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
GKAP1-202ENST00000376365 KIF3BO15066 747 aa39.03■■■■□ 3.84
GKAP1-202ENST00000376365 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.97■■■■□ 3.83
GKAP1-202ENST00000376365 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.96■■■■□ 3.83
GKAP1-202ENST00000376365 GGT6Q6P531 493 aa38.96■■■■□ 3.83
GKAP1-202ENST00000376365 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.93■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 MADDQ8WXG6 1647 aa38.91■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.9■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.9■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms