RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.25■□□□□ 0.83
FGD1-201ENST00000375135 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
FGD1-201ENST00000375135 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.23■□□□□ 0.83
FGD1-201ENST00000375135 TMF1P82094 1093 aa20.22■□□□□ 0.83
FGD1-201ENST00000375135 MLECQ14165 292 aa20.21■□□□□ 0.83
FGD1-201ENST00000375135 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.2■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 KIF3BO15066 747 aa20.19■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.19■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 CDCA8Q53HL2 280 aa20.18■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.16■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.15■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 RGS3P49796 1198 aa20.14■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 STK26Q9P289 416 aa20.14■□□□□ 0.82
FGD1-201ENST00000375135 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 TOPBP1Q92547 1522 aa20.13■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 NCOA2Q15596 1464 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.12■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 POGKQ9P215 609 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 PTPRGP23470 1445 aa20.11■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.1■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 HMGXB3Q12766 1538 aa20.09■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FGD1-201ENST00000375135 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.07■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.06■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 CCDC184Q52MB2 194 aa20.06■□□□□ 0.8
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FGD1-201ENST00000375135 UACAQ9BZF9 1416 aa20.05■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 C14orf37Q86TY3 774 aa20.05■□□□□ 0.8
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FGD1-201ENST00000375135 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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FGD1-201ENST00000375135 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.04■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 MSH5O43196 834 aa20.04■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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FGD1-201ENST00000375135 SOX12O15370 315 aa20.02■□□□□ 0.8
FGD1-201ENST00000375135 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.02■□□□□ 0.79
FGD1-201ENST00000375135 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
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FGD1-201ENST00000375135 NBPF8Q3BBV2 869 aa20■□□□□ 0.79
FGD1-201ENST00000375135 MORC1Q86VD1 984 aa20■□□□□ 0.79
FGD1-201ENST00000375135 RCAN3Q9UKA8 241 aa20■□□□□ 0.79
FGD1-201ENST00000375135 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
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FGD1-201ENST00000375135 PANK3Q9H999 370 aa20■□□□□ 0.79
FGD1-201ENST00000375135 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.99■□□□□ 0.79
FGD1-201ENST00000375135 WDR97A6NE52 1622 aa19.98■□□□□ 0.79
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FGD1-201ENST00000375135 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.95■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.95■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 PLIN1O60240 522 aa19.94■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 NLRP13Q86W25 1043 aa19.94■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.94■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 GRIN2BQ13224 1484 aa19.94■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 SLC4A3P48751 1232 aa19.93■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.93■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 AFAP1Q8N556 730 aa19.92■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 KIF15Q9NS87 1388 aa19.92■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 CCDC7Q96M83 1385 aa19.91■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.91■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.9■□□□□ 0.78
FGD1-201ENST00000375135 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.89■□□□□ 0.78
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FGD1-201ENST00000375135 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
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FGD1-201ENST00000375135 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
FGD1-201ENST00000375135 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
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FGD1-201ENST00000375135 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.84■□□□□ 0.77
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FGD1-201ENST00000375135 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.84■□□□□ 0.77
FGD1-201ENST00000375135 NAIPQ13075 1403 aa19.84■□□□□ 0.77
FGD1-201ENST00000375135 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
FGD1-201ENST00000375135 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.83■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.82■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 NUTM2FA1L443 756 aa19.82■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.82■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 BECN1Q14457 450 aa19.8■□□□□ 0.76
FGD1-201ENST00000375135 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.79■□□□□ 0.76
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