RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.07■■■□□ 2.08
FGD1-201ENST00000375135 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.4■■□□□ 1.98
FGD1-201ENST00000375135 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
FGD1-201ENST00000375135 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.45■■□□□ 1.83
FGD1-201ENST00000375135 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.37■■□□□ 1.65
FGD1-201ENST00000375135 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.92■■□□□ 1.58
FGD1-201ENST00000375135 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FGD1-201ENST00000375135 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
FGD1-201ENST00000375135 TRIM41Q8WV44 630 aa24.33■■□□□ 1.49
FGD1-201ENST00000375135 HRCP23327 699 aa24.29■■□□□ 1.48
FGD1-201ENST00000375135 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FGD1-201ENST00000375135 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.17■■□□□ 1.46
FGD1-201ENST00000375135 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.14■■□□□ 1.46
FGD1-201ENST00000375135 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FGD1-201ENST00000375135 APLP2Q06481 763 aa23.82■■□□□ 1.4
FGD1-201ENST00000375135 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
FGD1-201ENST00000375135 ABCC9O60706 1549 aa23.74■■□□□ 1.39
FGD1-201ENST00000375135 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FGD1-201ENST00000375135 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
FGD1-201ENST00000375135 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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FGD1-201ENST00000375135 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FGD1-201ENST00000375135 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
FGD1-201ENST00000375135 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
FGD1-201ENST00000375135 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
FGD1-201ENST00000375135 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
FGD1-201ENST00000375135 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
FGD1-201ENST00000375135 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.11■■□□□ 1.29
FGD1-201ENST00000375135 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FGD1-201ENST00000375135 ITGAEP38570 1179 aa23.05■■□□□ 1.28
FGD1-201ENST00000375135 SCRIBQ14160 1630 aa23.01■■□□□ 1.27
FGD1-201ENST00000375135 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.88■■□□□ 1.25
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FGD1-201ENST00000375135 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.79■■□□□ 1.24
FGD1-201ENST00000375135 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FGD1-201ENST00000375135 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.67■■□□□ 1.22
FGD1-201ENST00000375135 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.62■■□□□ 1.21
FGD1-201ENST00000375135 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
FGD1-201ENST00000375135 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
FGD1-201ENST00000375135 MYT1Q01538 1121 aa22.51■■□□□ 1.19
FGD1-201ENST00000375135 NEUROD1Q13562 356 aa22.51■■□□□ 1.19
FGD1-201ENST00000375135 P3H3Q8IVL6 736 aa22.42■■□□□ 1.18
FGD1-201ENST00000375135 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
FGD1-201ENST00000375135 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FGD1-201ENST00000375135 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.34■■□□□ 1.17
FGD1-201ENST00000375135 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FGD1-201ENST00000375135 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.26■■□□□ 1.15
FGD1-201ENST00000375135 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.25■■□□□ 1.15
FGD1-201ENST00000375135 NEFLP07196 543 aa22.23■■□□□ 1.15
FGD1-201ENST00000375135 ARID3CA6NKF2 412 aa22.22■■□□□ 1.15
FGD1-201ENST00000375135 BCANQ96GW7 911 aa22.14■■□□□ 1.14
FGD1-201ENST00000375135 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.07■■□□□ 1.12
FGD1-201ENST00000375135 FBLN2P98095 1184 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD1-201ENST00000375135 NACADO15069 1562 aa22.04■■□□□ 1.12
FGD1-201ENST00000375135 TRIM52Q96A61 297 aa22.04■■□□□ 1.12
FGD1-201ENST00000375135 MIER1Q8N108 512 aa22.01■■□□□ 1.11
FGD1-201ENST00000375135 MYT1LQ9UL68 1186 aa22■■□□□ 1.11
FGD1-201ENST00000375135 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.97■■□□□ 1.11
FGD1-201ENST00000375135 CEP162Q5TB80 1403 aa21.89■■□□□ 1.09
FGD1-201ENST00000375135 SOGA1O94964 1423 aa21.84■■□□□ 1.09
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FGD1-201ENST00000375135 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
FGD1-201ENST00000375135 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
FGD1-201ENST00000375135 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
FGD1-201ENST00000375135 ABCC8Q09428 1581 aa21.74■■□□□ 1.07
FGD1-201ENST00000375135 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
FGD1-201ENST00000375135 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
FGD1-201ENST00000375135 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.69■■□□□ 1.06
FGD1-201ENST00000375135 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.69■■□□□ 1.06
FGD1-201ENST00000375135 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
FGD1-201ENST00000375135 WIZO95785 1651 aa21.68■■□□□ 1.06
FGD1-201ENST00000375135 GOLGA3Q08378 1498 aa21.67■■□□□ 1.06
FGD1-201ENST00000375135 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.66■■□□□ 1.06
FGD1-201ENST00000375135 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
FGD1-201ENST00000375135 FKBP8Q14318 412 aa21.62■■□□□ 1.05
FGD1-201ENST00000375135 ANP32CO43423 234 aa21.6■■□□□ 1.05
FGD1-201ENST00000375135 EEA1Q15075 1411 aa21.59■■□□□ 1.05
FGD1-201ENST00000375135 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
FGD1-201ENST00000375135 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.48■■□□□ 1.03
FGD1-201ENST00000375135 KIF27Q86VH2 1401 aa21.43■■□□□ 1.02
FGD1-201ENST00000375135 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.43■■□□□ 1.02
FGD1-201ENST00000375135 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.43■■□□□ 1.02
FGD1-201ENST00000375135 TONSLQ96HA7 1378 aa21.42■■□□□ 1.02
FGD1-201ENST00000375135 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.42■■□□□ 1.02
FGD1-201ENST00000375135 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FGD1-201ENST00000375135 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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FGD1-201ENST00000375135 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 CUX2O14529 1486 aa21.28■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.27■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.27■■□□□ 1
FGD1-201ENST00000375135 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
FGD1-201ENST00000375135 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.24■□□□□ 0.99
FGD1-201ENST00000375135 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.24■□□□□ 0.99
FGD1-201ENST00000375135 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
FGD1-201ENST00000375135 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.21■□□□□ 0.99
FGD1-201ENST00000375135 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.2■□□□□ 0.98
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