RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.9■□□□□ 0.94
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A0A0G2JS52 829 aa20.86■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.83■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RGS3P49796 1198 aa20.83■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.83■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARXQ96QS3 562 aa20.83■□□□□ 0.93
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GGT6Q6P531 493 aa20.82■□□□□ 0.92
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.81■□□□□ 0.92
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE3BQ13370 1112 aa20.78■□□□□ 0.92
HS3ST3B1-201ENST00000360954 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.78■□□□□ 0.92
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HS3ST3B1-201ENST00000360954 JPH4Q96JJ6 628 aa20.76■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLEKHG5O94827 1062 aa20.76■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.76■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.75■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FOXD1Q16676 465 aa20.75■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UACAQ9BZF9 1416 aa20.75■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MCCP23508 829 aa20.74■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NLRP13Q86W25 1043 aa20.74■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.74■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.73■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HSCBQ8IWL3 235 aa20.73■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.72■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF3BO15066 747 aa20.71■□□□□ 0.91
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF15Q9NS87 1388 aa20.69■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.92e-10■□□□□ 11
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MLECQ14165 292 aa20.68■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.67■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTMSP20962 102 aa20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CUX1P39880 1505 aa20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KCNJ4P48050 445 aa20.66■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.65■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STK26Q9P289 416 aa20.65■□□□□ 0.9
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NCAPD3P42695 1498 aa20.64■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.64■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FGD1P98174 961 aa20.64■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTPRGP23470 1445 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA2Q08379 1002 aa20.63■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.62■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.62■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IGF1RP08069 1367 aa20.61■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.61■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.61■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STAC3Q96MF2 364 aa20.6■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NRDCO43847 1150 aa20.6■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EID1Q9Y6B2 187 aa20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NGEFQ8N5V2 710 aa20.55■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.54■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.54■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STK31Q9BXU1 1019 aa20.53■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NPHP1O15259 732 aa20.53■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF21BO75037 1637 aa20.52■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HMMRO75330 724 aa20.52■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.52■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.51■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.51■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GBP4Q96PP9 640 aa20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SOX12O15370 315 aa20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.48■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP47Q96K76 1375 aa20.48■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EVC2Q86UK5 1308 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPATCH3Q96I76 525 aa20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PANK3Q9H999 370 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms