RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 NUDCQ9Y266 331 aa25.53■■□□□ 1.68
PRPF39-201ENST00000355765 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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PRPF39-201ENST00000355765 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.48■■□□□ 1.67
PRPF39-201ENST00000355765 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.47■■□□□ 1.67
PRPF39-201ENST00000355765 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PRPF39-201ENST00000355765 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.45■■□□□ 1.66
PRPF39-201ENST00000355765 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PRPF39-201ENST00000355765 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.44■■□□□ 1.66
PRPF39-201ENST00000355765 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.44■■□□□ 1.66
PRPF39-201ENST00000355765 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.41■■□□□ 1.66
PRPF39-201ENST00000355765 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.39■■□□□ 1.65
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PRPF39-201ENST00000355765 KDM6BO15054 1643 aa25.35■■□□□ 1.65
PRPF39-201ENST00000355765 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.34■■□□□ 1.65
PRPF39-201ENST00000355765 PDE4AP27815 886 aa25.32■■□□□ 1.64
PRPF39-201ENST00000355765 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.32■■□□□ 1.64
PRPF39-201ENST00000355765 HECW1Q76N89 1606 aa25.3■■□□□ 1.64
PRPF39-201ENST00000355765 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.3■■□□□ 1.64
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PRPF39-201ENST00000355765 USP35Q9P2H5 1018 aa25.27■■□□□ 1.64
PRPF39-201ENST00000355765 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.26■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.26■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.26■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.25■■□□□ 1.63
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PRPF39-201ENST00000355765 BACH2Q9BYV9 841 aa25.23■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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PRPF39-201ENST00000355765 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.21■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.2■■□□□ 1.63
PRPF39-201ENST00000355765 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.18■■□□□ 1.62
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.17■■□□□ 1.62
PRPF39-201ENST00000355765 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.17■■□□□ 1.62
PRPF39-201ENST00000355765 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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PRPF39-201ENST00000355765 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.15■■□□□ 1.62
PRPF39-201ENST00000355765 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.15■■□□□ 1.62
PRPF39-201ENST00000355765 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRPF39-201ENST00000355765 GRIN2BQ13224 1484 aa25.14■■□□□ 1.61
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PRPF39-201ENST00000355765 SLC4A3P48751 1232 aa25.13■■□□□ 1.61
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PRPF39-201ENST00000355765 ARID3CA6NKF2 412 aa25.12■■□□□ 1.61
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PRPF39-201ENST00000355765 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PRPF39-201ENST00000355765 PLIN1O60240 522 aa25.06■■□□□ 1.6
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGEF11O15085 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
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PRPF39-201ENST00000355765 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.02■■□□□ 1.6
PRPF39-201ENST00000355765 IFT140Q96RY7 1462 aa25.01■■□□□ 1.59
PRPF39-201ENST00000355765 PBRM1Q86U86 1689 aa25■■□□□ 1.59
PRPF39-201ENST00000355765 SAMD9Q5K651 1589 aa25■■□□□ 1.59
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PRPF39-201ENST00000355765 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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PRPF39-201ENST00000355765 KIF15Q9NS87 1388 aa24.93■■□□□ 1.58
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PRPF39-201ENST00000355765 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PRPF39-201ENST00000355765 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 ADAMTS12P58397 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 DAPK1P53355 1430 aa24.88■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.87■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 KDM5CP41229 1560 aa24.86■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 MBD5Q9P267 1494 aa24.85■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 RALBP1Q15311 655 aa24.84■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.84■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 ABCC5O15440 1437 aa24.84■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.83■■□□□ 1.57
PRPF39-201ENST00000355765 FBLN2P98095 1184 aa24.82■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 PDE3BQ13370 1112 aa24.82■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.82■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 ROCK1Q13464 1354 aa24.81■■□□□ 1.56
PRPF39-201ENST00000355765 PZPP20742 1482 aa24.81■■□□□ 1.56
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