RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348495.10

SSBP4-202, Transcript of single stranded DNA binding protein 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene SSBP4, Length 1,721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4-202ENST00000348495 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
SSBP4-202ENST00000348495 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.215e-7■■■□□ 17.3
SSBP4-202ENST00000348495 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.33■■■■■ 4.21
SSBP4-202ENST00000348495 CD109Q6YHK3 1445 aa41.31■■■■■ 4.2
SSBP4-202ENST00000348495 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.31■■■■■ 4.2
SSBP4-202ENST00000348495 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.3■■■■■ 4.2
SSBP4-202ENST00000348495 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.28■■■■■ 4.2
SSBP4-202ENST00000348495 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
SSBP4-202ENST00000348495 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.25■■■■■ 4.19
SSBP4-202ENST00000348495 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
SSBP4-202ENST00000348495 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.23■■■■■ 4.19
SSBP4-202ENST00000348495 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.21■■■■■ 4.19
SSBP4-202ENST00000348495 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
SSBP4-202ENST00000348495 FANCAO15360 1455 aa41.18■■■■■ 4.18
SSBP4-202ENST00000348495 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.16■■■■■ 4.18
SSBP4-202ENST00000348495 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.11■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.1■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.09■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 ABCC1P33527 1531 aa41.09■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 MBD5Q9P267 1494 aa41.08■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
SSBP4-202ENST00000348495 NEO1Q92859 1461 aa41.06■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.05■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 AKNAQ7Z591 1439 aa41.04■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.04■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.04■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 ABCC5O15440 1437 aa41.02■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 DAPK1P53355 1430 aa41.02■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 PTPRKQ15262 1439 aa41.01■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 TSPOAP1O95153 1857 aa41.01■■■■■ 4.16
SSBP4-202ENST00000348495 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.151e-6■■□□□ 12.6
SSBP4-202ENST00000348495 ITGAEP38570 1179 aa40.99■■■■■ 4.15
SSBP4-202ENST00000348495 ADGRL1O94910 1474 aa40.99■■■■■ 4.15
SSBP4-202ENST00000348495 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.98■■■■■ 4.15
SSBP4-202ENST00000348495 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.95■■■■■ 4.15
SSBP4-202ENST00000348495 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.94■■■■■ 4.14
SSBP4-202ENST00000348495 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.93■■■■■ 4.14
SSBP4-202ENST00000348495 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.92■■■■■ 4.14
SSBP4-202ENST00000348495 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
SSBP4-202ENST00000348495 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.9■■■■■ 4.14
SSBP4-202ENST00000348495 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.88■■■■■ 4.14
SSBP4-202ENST00000348495 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.8■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.8■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.8■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 ROCK1Q13464 1354 aa40.78■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 TSPY4P0CV99 314 aa40.78■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 TSPY10P0CW01 314 aa40.78■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 AFAP1Q8N556 730 aa40.78■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 ADGRL2O95490 1459 aa40.78■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.77■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.77■■■■■ 4.12
SSBP4-202ENST00000348495 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.75■■■■■ 4.11
SSBP4-202ENST00000348495 KDM5CP41229 1560 aa40.73■■■■■ 4.11
SSBP4-202ENST00000348495 RICTORQ6R327 1708 aa40.71■■■■■ 4.11
SSBP4-202ENST00000348495 NCOA1Q15788 1441 aa40.7■■■■■ 4.11
SSBP4-202ENST00000348495 HFM1A2PYH4 1435 aa40.7■■■■■ 4.11
SSBP4-202ENST00000348495 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.67■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.67■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.66■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.66■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 RAPGEF3O95398 923 aa40.65■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 NAIPQ13075 1403 aa40.65■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
SSBP4-202ENST00000348495 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.63■■■■■ 4.09
SSBP4-202ENST00000348495 PLXNC1O60486 1568 aa40.63■■■■■ 4.09
SSBP4-202ENST00000348495 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.62■■■■■ 4.09
SSBP4-202ENST00000348495 ATP7AQ04656 1500 aa40.61■■■■■ 4.09
SSBP4-202ENST00000348495 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.61■■■■■ 4.09
SSBP4-202ENST00000348495 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.6■■■■■ 4.09
SSBP4-202ENST00000348495 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.57■■■■■ 4.08
SSBP4-202ENST00000348495 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.57■■■■■ 4.08
SSBP4-202ENST00000348495 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.56■■■■■ 4.08
SSBP4-202ENST00000348495 KIF15Q9NS87 1388 aa40.54■■■■■ 4.08
SSBP4-202ENST00000348495 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.51■■■■■ 4.08
SSBP4-202ENST00000348495 KDM6BO15054 1643 aa40.45■■■■■ 4.07
SSBP4-202ENST00000348495 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.45■■■■■ 4.07
SSBP4-202ENST00000348495 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.45■■■■■ 4.07
SSBP4-202ENST00000348495 HRCP23327 699 aa40.44■■■■■ 4.06
SSBP4-202ENST00000348495 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.43■■■■■ 4.06
SSBP4-202ENST00000348495 ABCA6Q8N139 1617 aa40.41■■■■■ 4.06
SSBP4-202ENST00000348495 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.41■■■■■ 4.06
SSBP4-202ENST00000348495 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.38■■■■■ 4.05
SSBP4-202ENST00000348495 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.37■■■■■ 4.05
SSBP4-202ENST00000348495 ERBINQ96RT1 1412 aa40.35■■■■■ 4.05
SSBP4-202ENST00000348495 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
SSBP4-202ENST00000348495 A2MP01023 1474 aa40.3■■■■■ 4.04
SSBP4-202ENST00000348495 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.27■■■■■ 4.04
SSBP4-202ENST00000348495 ATP10AO60312 1499 aa40.23■■■■■ 4.03
SSBP4-202ENST00000348495 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SSBP4-202ENST00000348495 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SSBP4-202ENST00000348495 REREQ9P2R6 1566 aa40.2■■■■■ 4.03
SSBP4-202ENST00000348495 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.16■■■■■ 4.02
SSBP4-202ENST00000348495 UNC13BO14795 1591 aa40.15■■■■■ 4.02
SSBP4-202ENST00000348495 DEPDC5O75140 1603 aa40.11■■■■■ 4.01
SSBP4-202ENST00000348495 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
SSBP4-202ENST00000348495 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms