RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 MIA2Q96PC5 1412 aa21.03■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PMS1-201ENST00000342075 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.01■□□□□ 0.95
PMS1-201ENST00000342075 MAPKBP1O60336 1514 aa21.01■□□□□ 0.95
PMS1-201ENST00000342075 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21■□□□□ 0.95
PMS1-201ENST00000342075 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.99■□□□□ 0.95
PMS1-201ENST00000342075 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.99■□□□□ 0.95
PMS1-201ENST00000342075 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.954e-6■■■■□ 23.6
PMS1-201ENST00000342075 PLCH2O75038 1416 aa20.96■□□□□ 0.95
PMS1-201ENST00000342075 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 ABCC5O15440 1437 aa20.92■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.92■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 DAPK1P53355 1430 aa20.92■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 DIP2BQ9P265 1576 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 CD109Q6YHK3 1445 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.9■□□□□ 0.94
PMS1-201ENST00000342075 FANCAO15360 1455 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 TSPOAP1O95153 1857 aa20.89■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 MBD5Q9P267 1494 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.84■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.84■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 ABCC1P33527 1531 aa20.83■□□□□ 0.93
PMS1-201ENST00000342075 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.82■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.82■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 KDM6BO15054 1643 aa20.81■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 AFAP1Q8N556 730 aa20.8■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.8■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 GLI2P10070 1586 aa20.79■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 ADGRL1O94910 1474 aa20.79■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 NAIPQ13075 1403 aa20.79■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.78■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.78■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.78■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.78■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 AKNAQ7Z591 1439 aa20.78■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-201ENST00000342075 HFM1A2PYH4 1435 aa20.76■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.75■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 TSPY4P0CV99 314 aa20.74■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 TSPY10P0CW01 314 aa20.74■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.74■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.73■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 NCOA1Q15788 1441 aa20.73■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.72■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 RAPGEF3O95398 923 aa20.72■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PMS1-201ENST00000342075 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.7■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 ROCK1Q13464 1354 aa20.69■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 ADGRL2O95490 1459 aa20.68■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.68■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.67■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 KIF15Q9NS87 1388 aa20.66■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.66■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 NEO1Q92859 1461 aa20.66■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.65■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
PMS1-201ENST00000342075 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.64■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.64■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.63■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 ATP7AQ04656 1500 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.61■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 RICTORQ6R327 1708 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 TRIM52Q96A61 297 aa20.6■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 PLXNC1O60486 1568 aa20.58■□□□□ 0.89
PMS1-201ENST00000342075 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.58■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 KDM5CP41229 1560 aa20.57■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.54■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 HRCP23327 699 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 FOXD1Q16676 465 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 ABCA6Q8N139 1617 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-201ENST00000342075 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.874e-6■■□□□ 13.1
PMS1-201ENST00000342075 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-201ENST00000342075 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.49■□□□□ 0.87
PMS1-201ENST00000342075 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-201ENST00000342075 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-201ENST00000342075 PZPP20742 1482 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-201ENST00000342075 NUP155O75694 1391 aa20.46■□□□□ 0.87
PMS1-201ENST00000342075 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.44■□□□□ 0.86
PMS1-201ENST00000342075 ERBINQ96RT1 1412 aa20.44■□□□□ 0.86
PMS1-201ENST00000342075 KIF3BO15066 747 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-201ENST00000342075 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PMS1-201ENST00000342075 A2MP01023 1474 aa20.43■□□□□ 0.86
PMS1-201ENST00000342075 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PMS1-201ENST00000342075 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.42■□□□□ 0.86
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