RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.04■■□□□ 1.6
SNN-201ENST00000329565 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SNN-201ENST00000329565 KDM6BO15054 1643 aa25.01■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 NCOA1Q15788 1441 aa25.01■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 SKAP1Q86WV1 359 aa24.99■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 PRDM2Q13029 1718 aa24.98■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.95■■□□□ 1.59
SNN-201ENST00000329565 SLC4A3P48751 1232 aa24.95■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 NUDCQ9Y266 331 aa24.94■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.93■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 NESP48681 1621 aa24.92■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.92■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.91■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 TOPBP1Q92547 1522 aa24.91■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SNN-201ENST00000329565 GRIN2BQ13224 1484 aa24.88■■□□□ 1.57
SNN-201ENST00000329565 TMC1Q8TDI8 760 aa24.88■■□□□ 1.57
SNN-201ENST00000329565 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.84■■□□□ 1.57
SNN-201ENST00000329565 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SNN-201ENST00000329565 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.84■■□□□ 1.57
SNN-201ENST00000329565 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.83■■□□□ 1.57
SNN-201ENST00000329565 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.82■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.81■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 HECW1Q76N89 1606 aa24.8■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 CUL7Q14999 1698 aa24.79■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.78■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 PDE4AP27815 886 aa24.78■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SNN-201ENST00000329565 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.76■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 USP47Q96K76 1375 aa24.75■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.73■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.73■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 SAMD9Q5K651 1589 aa24.72■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.72■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 ARXQ96QS3 562 aa24.71■■□□□ 1.55
SNN-201ENST00000329565 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.7■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 PLIN1O60240 522 aa24.69■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 PKD2Q13563 968 aa24.67■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.67■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 ARHGEF11O15085 1522 aa24.67■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.66■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 GSE1Q14687 1217 aa24.65■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 DAPK1P53355 1430 aa24.64■■□□□ 1.54
SNN-201ENST00000329565 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.63■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 ABCC5O15440 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.61■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 NFKBIBQ15653 356 aa24.61■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.61■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.6■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 MIA2Q96PC5 1412 aa24.59■■□□□ 1.53
SNN-201ENST00000329565 BACH2Q9BYV9 841 aa24.58■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 USP35Q9P2H5 1018 aa24.53■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.53■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.53■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.52■■□□□ 1.52
SNN-201ENST00000329565 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.51■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.49■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 ROCK1Q13464 1354 aa24.49■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 KIF15Q9NS87 1388 aa24.49■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 PZPP20742 1482 aa24.49■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
SNN-201ENST00000329565 CRBNQ96SW2 442 aa24.45■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.44■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 RGL3Q3MIN7 710 aa24.44■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 RGS3P49796 1198 aa24.43■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.43■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 NUP155O75694 1391 aa24.41■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 RALBP1Q15311 655 aa24.41■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 IQGAP2Q13576 1575 aa24.39■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.39■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 WDR62O43379 1518 aa24.39■■□□□ 1.5
SNN-201ENST00000329565 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 NLRP13Q86W25 1043 aa24.38■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 KDM5CP41229 1560 aa24.37■■□□□ 1.49
SNN-201ENST00000329565 MBD5Q9P267 1494 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms