RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 NCOA2Q15596 1464 aa27.59■■■□□ 2.01
SYNE4-201ENST00000324444 FANCAO15360 1455 aa27.57■■■□□ 2
SYNE4-201ENST00000324444 AKNAQ7Z591 1439 aa27.54■■■□□ 2
SYNE4-201ENST00000324444 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.53■■■□□ 2
SYNE4-201ENST00000324444 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.53■■■□□ 2
SYNE4-201ENST00000324444 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SYNE4-201ENST00000324444 PLCH2O75038 1416 aa27.5■■□□□ 1.99
SYNE4-201ENST00000324444 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.48■■□□□ 1.99
SYNE4-201ENST00000324444 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.48■■□□□ 1.99
SYNE4-201ENST00000324444 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.46■■□□□ 1.99
SYNE4-201ENST00000324444 RICTORQ6R327 1708 aa27.44■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.44■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.44■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 PREX2Q70Z35 1606 aa27.43■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.4■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.39■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.39■■□□□ 1.98
SYNE4-201ENST00000324444 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.39■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.37■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.37■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 MIA2Q96PC5 1412 aa27.36■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.35■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.35■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.34■■□□□ 1.97
SYNE4-201ENST00000324444 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.31■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.3■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.3■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.28■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.28■■□□□ 1.96
SYNE4-201ENST00000324444 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.26■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.25■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.23■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.22■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 AFAP1Q8N556 730 aa27.21■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRMP28827 1452 aa27.2■■□□□ 1.95
SYNE4-201ENST00000324444 MADDQ8WXG6 1647 aa27.2■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.19■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.18■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC1P33527 1531 aa27.17■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 KDM5CP41229 1560 aa27.16■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 ATP10AO60312 1499 aa27.16■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.14■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.14■■□□□ 1.94
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.13■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.13■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 MLECQ14165 292 aa27.12■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.12■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.12■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.12■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 MBD5Q9P267 1494 aa27.11■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.1■■□□□ 1.93
SYNE4-201ENST00000324444 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.07■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 DAPK1P53355 1430 aa27.05■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.05■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC5O15440 1437 aa27.03■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 ABCA6Q8N139 1617 aa27.02■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.02■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.02■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRKQ15262 1439 aa27.01■■□□□ 1.92
SYNE4-201ENST00000324444 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.01■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.97■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 REREQ9P2R6 1566 aa26.97■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.97■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.97■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 ITGAEP38570 1179 aa26.97■■□□□ 1.91
SYNE4-201ENST00000324444 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.95■■□□□ 1.9
SYNE4-201ENST00000324444 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRL2O95490 1459 aa26.92■■□□□ 1.9
SYNE4-201ENST00000324444 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SYNE4-201ENST00000324444 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.9■■□□□ 1.9
SYNE4-201ENST00000324444 AGLP35573 1532 aa26.89■■□□□ 1.9
SYNE4-201ENST00000324444 ROCK1Q13464 1354 aa26.88■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 ATP7AQ04656 1500 aa26.87■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 PLXNC1O60486 1568 aa26.87■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.85■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 HRCP23327 699 aa26.84■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.84■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 NCOA1Q15788 1441 aa26.83■■□□□ 1.89
SYNE4-201ENST00000324444 TSPY4P0CV99 314 aa26.83■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 TSPY10P0CW01 314 aa26.83■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 HFM1A2PYH4 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.82■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 HSPA2P54652 639 aa26.8■■□□□ 1.88
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