RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.43■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.41■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.4■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.39■■■□□ 2.46
PPARG-202ENST00000309576 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.37■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.36■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.35■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 FANCAO15360 1455 aa30.33■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.33■■■□□ 2.45
PPARG-202ENST00000309576 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.29■■■□□ 2.44
PPARG-202ENST00000309576 MBD5Q9P267 1494 aa30.26■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.26■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.24■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 AKNAQ7Z591 1439 aa30.23■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.23■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 NEO1Q92859 1461 aa30.22■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 ABCC1P33527 1531 aa30.22■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 PTPRKQ15262 1439 aa30.21■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 ABCC5O15440 1437 aa30.21■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.21■■■□□ 2.43
PPARG-202ENST00000309576 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 ITGAEP38570 1179 aa30.2■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 DAPK1P53355 1430 aa30.18■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 ADGRL1O94910 1474 aa30.18■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.18■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.17■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.16■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.15■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 TSPOAP1O95153 1857 aa30.15■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.14■■■□□ 2.42
PPARG-202ENST00000309576 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.14■■■□□ 2.41
PPARG-202ENST00000309576 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.12■■■□□ 2.41
PPARG-202ENST00000309576 AFAP1Q8N556 730 aa30.08■■■□□ 2.41
PPARG-202ENST00000309576 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.06■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.06■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.04■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.04■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 TSPY4P0CV99 314 aa30.04■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 TSPY10P0CW01 314 aa30.04■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.03■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.01■■■□□ 2.4
PPARG-202ENST00000309576 RAPGEF3O95398 923 aa30■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 ROCK1Q13464 1354 aa30■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 ADGRL2O95490 1459 aa29.99■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 NCOA1Q15788 1441 aa29.98■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.98■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 KDM5CP41229 1560 aa29.97■■■□□ 2.39
PPARG-202ENST00000309576 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 HFM1A2PYH4 1435 aa29.95■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.94■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.94■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 RICTORQ6R327 1708 aa29.94■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.93■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 NAIPQ13075 1403 aa29.92■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.92■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.92■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.9■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PPARG-202ENST00000309576 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.89■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 ATP7AQ04656 1500 aa29.87■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.87■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 KIF15Q9NS87 1388 aa29.85■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.85■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 PLXNC1O60486 1568 aa29.85■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.84■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.83■■■□□ 2.37
PPARG-202ENST00000309576 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.81■■■□□ 2.36
PPARG-202ENST00000309576 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.8■■■□□ 2.36
PPARG-202ENST00000309576 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.77■■■□□ 2.36
PPARG-202ENST00000309576 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.77■■■□□ 2.36
PPARG-202ENST00000309576 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.77■■■□□ 2.36
PPARG-202ENST00000309576 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.76■■■□□ 2.36
PPARG-202ENST00000309576 KDM6BO15054 1643 aa29.76■■■□□ 2.35
PPARG-202ENST00000309576 HRCP23327 699 aa29.75■■■□□ 2.35
PPARG-202ENST00000309576 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.74■■■□□ 2.35
PPARG-202ENST00000309576 ABCA6Q8N139 1617 aa29.72■■■□□ 2.35
PPARG-202ENST00000309576 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.71■■■□□ 2.35
PPARG-202ENST00000309576 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
PPARG-202ENST00000309576 ERBINQ96RT1 1412 aa29.68■■■□□ 2.34
PPARG-202ENST00000309576 A2MP01023 1474 aa29.67■■■□□ 2.34
PPARG-202ENST00000309576 ATP10AO60312 1499 aa29.62■■■□□ 2.33
PPARG-202ENST00000309576 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.61■■■□□ 2.33
PPARG-202ENST00000309576 REREQ9P2R6 1566 aa29.57■■■□□ 2.32
PPARG-202ENST00000309576 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PPARG-202ENST00000309576 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PPARG-202ENST00000309576 KIF3BO15066 747 aa29.54■■■□□ 2.32
PPARG-202ENST00000309576 TRIM52Q96A61 297 aa29.51■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 UNC13BO14795 1591 aa29.5■■■□□ 2.31
PPARG-202ENST00000309576 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.5■■■□□ 2.31
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