RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305264.7

HDAC3-201, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC3, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-201ENST00000305264 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.86■■■■■ 4.29
HDAC3-201ENST00000305264 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.86■■■■■ 4.29
HDAC3-201ENST00000305264 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.8■■■■■ 4.28
HDAC3-201ENST00000305264 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
HDAC3-201ENST00000305264 FANCAO15360 1455 aa41.77■■■■■ 4.28
HDAC3-201ENST00000305264 MIA2Q96PC5 1412 aa41.76■■■■■ 4.27
HDAC3-201ENST00000305264 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.72■■■■■ 4.27
HDAC3-201ENST00000305264 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.72■■■■■ 4.27
HDAC3-201ENST00000305264 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.71■■■■■ 4.27
HDAC3-201ENST00000305264 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.7■■■■■ 4.27
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
HDAC3-201ENST00000305264 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.69■■■■■ 4.26
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
HDAC3-201ENST00000305264 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.67■■■■■ 4.26
HDAC3-201ENST00000305264 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
HDAC3-201ENST00000305264 NEO1Q92859 1461 aa41.65■■■■■ 4.26
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HDAC3-201ENST00000305264 AKNAQ7Z591 1439 aa41.62■■■■■ 4.25
HDAC3-201ENST00000305264 ABCC1P33527 1531 aa41.61■■■■■ 4.25
HDAC3-201ENST00000305264 ADGRL1O94910 1474 aa41.57■■■■■ 4.25
HDAC3-201ENST00000305264 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.57■■■■■ 4.25
HDAC3-201ENST00000305264 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
HDAC3-201ENST00000305264 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.54■■■■■ 4.24
HDAC3-201ENST00000305264 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.53■■■■■ 4.24
HDAC3-201ENST00000305264 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.5■■■■■ 4.23
HDAC3-201ENST00000305264 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.48■■■■■ 4.23
HDAC3-201ENST00000305264 MBD5Q9P267 1494 aa41.47■■■■■ 4.23
HDAC3-201ENST00000305264 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
HDAC3-201ENST00000305264 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
HDAC3-201ENST00000305264 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.42■■■■■ 4.22
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HDAC3-201ENST00000305264 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.41■■■■■ 4.22
HDAC3-201ENST00000305264 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
HDAC3-201ENST00000305264 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.38■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 RICTORQ6R327 1708 aa41.37■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.36■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.35■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.35■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 DAPK1P53355 1430 aa41.35■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 ABCC5O15440 1437 aa41.33■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.32■■■■■ 4.21
HDAC3-201ENST00000305264 RAPGEF3O95398 923 aa41.31■■■■■ 4.2
HDAC3-201ENST00000305264 KDM6BO15054 1643 aa41.31■■■■■ 4.2
HDAC3-201ENST00000305264 AFAP1Q8N556 730 aa41.3■■■■■ 4.2
HDAC3-201ENST00000305264 KDM5CP41229 1560 aa41.29■■■■■ 4.2
HDAC3-201ENST00000305264 ITGAEP38570 1179 aa41.28■■■■■ 4.2
HDAC3-201ENST00000305264 PTPRKQ15262 1439 aa41.26■■■■■ 4.2
HDAC3-201ENST00000305264 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.25■■■■■ 4.19
HDAC3-201ENST00000305264 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
HDAC3-201ENST00000305264 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.22■■■■■ 4.19
HDAC3-201ENST00000305264 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.2■■■■■ 4.19
HDAC3-201ENST00000305264 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.18■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.18■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.17■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.17■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 TSPY4P0CV99 314 aa41.15■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 TSPY10P0CW01 314 aa41.15■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
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HDAC3-201ENST00000305264 ATP7AQ04656 1500 aa41.13■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.13■■■■■ 4.18
HDAC3-201ENST00000305264 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.13■■■■■ 4.17
HDAC3-201ENST00000305264 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.11■■■■■ 4.17
HDAC3-201ENST00000305264 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.07■■■■■ 4.17
HDAC3-201ENST00000305264 ADGRL2O95490 1459 aa41.07■■■■■ 4.16
HDAC3-201ENST00000305264 PLXNC1O60486 1568 aa41.04■■■■■ 4.16
HDAC3-201ENST00000305264 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.03■■■■■ 4.16
HDAC3-201ENST00000305264 ABCA6Q8N139 1617 aa41.03■■■■■ 4.16
HDAC3-201ENST00000305264 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.02■■■■■ 4.16
HDAC3-201ENST00000305264 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.02■■■■■ 4.16
HDAC3-201ENST00000305264 NCOA1Q15788 1441 aa41■■■■■ 4.15
HDAC3-201ENST00000305264 ROCK1Q13464 1354 aa40.99■■■■■ 4.15
HDAC3-201ENST00000305264 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.99■■■■■ 4.15
HDAC3-201ENST00000305264 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.98■■■■■ 4.15
HDAC3-201ENST00000305264 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.97■■■■■ 4.15
HDAC3-201ENST00000305264 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.94■■■■■ 4.14
HDAC3-201ENST00000305264 KIF15Q9NS87 1388 aa40.93■■■■■ 4.14
HDAC3-201ENST00000305264 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.92■■■■■ 4.14
HDAC3-201ENST00000305264 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.89■■■■■ 4.14
HDAC3-201ENST00000305264 HFM1A2PYH4 1435 aa40.87■■■■■ 4.13
HDAC3-201ENST00000305264 NAIPQ13075 1403 aa40.85■■■■■ 4.13
HDAC3-201ENST00000305264 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.84■■■■■ 4.13
HDAC3-201ENST00000305264 ATP10AO60312 1499 aa40.82■■■■■ 4.13
HDAC3-201ENST00000305264 A2MP01023 1474 aa40.81■■■■■ 4.12
HDAC3-201ENST00000305264 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.77■■■■■ 4.12
HDAC3-201ENST00000305264 REREQ9P2R6 1566 aa40.76■■■■■ 4.12
HDAC3-201ENST00000305264 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
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HDAC3-201ENST00000305264 ERBINQ96RT1 1412 aa40.73■■■■■ 4.11
HDAC3-201ENST00000305264 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.71■■■■■ 4.11
HDAC3-201ENST00000305264 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
HDAC3-201ENST00000305264 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.63■■■■■ 4.1
HDAC3-201ENST00000305264 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.63■■■■■ 4.09
HDAC3-201ENST00000305264 AGLP35573 1532 aa40.62■■■■■ 4.09
HDAC3-201ENST00000305264 KIF3BO15066 747 aa40.57■■■■■ 4.08
HDAC3-201ENST00000305264 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
HDAC3-201ENST00000305264 DEPDC5O75140 1603 aa40.54■■■■■ 4.08
HDAC3-201ENST00000305264 UNC13BO14795 1591 aa40.52■■■■■ 4.08
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