RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.45■■■□□ 2.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.44■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.43■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.43■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.4■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.4■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF11O15085 1522 aa30.38■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CUL7Q14999 1698 aa30.37■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM6BO15054 1643 aa30.37■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GRIN2BQ13224 1484 aa30.36■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE4AP27815 886 aa30.35■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MS4A1P11836 297 aa30.34■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.34■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BACH2Q9BYV9 841 aa30.34■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.34■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.33■■■□□ 2.45
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MIA2Q96PC5 1412 aa30.31■■■□□ 2.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAMD9Q5K651 1589 aa30.3■■■□□ 2.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.3■■■□□ 2.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.29■■■□□ 2.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXD1Q16676 465 aa30.25■■■□□ 2.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GSE1Q14687 1217 aa30.22■■■□□ 2.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRPF3Q9ULD4 1205 aa30.21■■■□□ 2.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.2■■■□□ 2.43
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDRGK1Q96HY6 314 aa30.19■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMC1Q8TDI8 760 aa30.18■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.18■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.17■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.16■■■□□ 2.42
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.13■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.12■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.11■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP47Q96K76 1375 aa30.09■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NFKBIBQ15653 356 aa30.08■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ROCK1Q13464 1354 aa30.08■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.07■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MBD5Q9P267 1494 aa30.06■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.05■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.04■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF15Q9NS87 1388 aa30.03■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE3BQ13370 1112 aa30.02■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM5CP41229 1560 aa30.01■■■□□ 2.4
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOPBP1Q92547 1522 aa29.99■■■□□ 2.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF14Q15058 1648 aa29.98■■■□□ 2.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.97■■■□□ 2.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RALBP1Q15311 655 aa29.96■■■□□ 2.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAPK1P53355 1430 aa29.96■■■□□ 2.39
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.93■■■□□ 2.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NESP48681 1621 aa29.9■■■□□ 2.38
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC5O15440 1437 aa29.87■■■□□ 2.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PZPP20742 1482 aa29.87■■■□□ 2.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 E9PCH4 1651 aa29.85■■■□□ 2.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.82■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.82■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.81■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CRBNQ96SW2 442 aa29.79■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC4A3P48751 1232 aa29.78■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NLRP13Q86W25 1043 aa29.78■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.77■■■□□ 2.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 INSRP06213 1382 aa29.76■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SKAP1Q86WV1 359 aa29.75■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLIN1O60240 522 aa29.75■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.75■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.74■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.74■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.72■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.72■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.71■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.71■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM161AQ3B820 660 aa29.71■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR62O43379 1518 aa29.7■■■□□ 2.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
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