RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.17■■■■□ 3.38
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.12■■■■□ 3.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.11■■■■□ 3.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HRCP23327 699 aa36.11■■■■□ 3.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCH2O75038 1416 aa36.1■■■■□ 3.37
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.06■■■■□ 3.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPRKQ15262 1439 aa36.04■■■■□ 3.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DIP2BQ9P265 1576 aa36.03■■■■□ 3.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD109Q6YHK3 1445 aa35.99■■■■□ 3.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.97■■■■□ 3.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GLI2P10070 1586 aa35.95■■■■□ 3.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.95■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.94■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.94■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCC5O15440 1437 aa35.93■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DAPK1P53355 1430 aa35.93■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FANCAO15360 1455 aa35.93■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.92■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.91■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.89■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.89■■■■□ 3.34
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MBD5Q9P267 1494 aa35.88■■■■□ 3.33
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCC1P33527 1531 aa35.85■■■■□ 3.33
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.83■■■■□ 3.33
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPOAP1O95153 1857 aa35.82■■■■□ 3.33
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.81■■■■□ 3.32
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.79■■■■□ 3.32
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.79■■■■□ 3.32
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AKNAQ7Z591 1439 aa35.78■■■■□ 3.32
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.76■■■■□ 3.32
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADGRL1O94910 1474 aa35.76■■■■□ 3.31
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.76■■■■□ 3.31
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.76■■■■□ 3.31
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.72■■■■□ 3.31
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.72■■■■□ 3.31
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.7■■■■□ 3.31
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AFAP1Q8N556 730 aa35.69■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAIPQ13075 1403 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HFM1A2PYH4 1435 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEO1Q92859 1461 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPY4P0CV99 314 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPY10P0CW01 314 aa35.67■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.66■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.64■■■■□ 3.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ROCK1Q13464 1354 aa35.63■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADGRL2O95490 1459 aa35.62■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCOA1Q15788 1441 aa35.62■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KDM6BO15054 1643 aa35.6■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.6■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.58■■■■□ 3.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.56■■■■□ 3.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.55■■■■□ 3.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.54■■■■□ 3.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAPGEF3O95398 923 aa35.54■■■■□ 3.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.5■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.5■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF15Q9NS87 1388 aa35.49■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RICTORQ6R327 1708 aa35.47■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KDM5CP41229 1560 aa35.45■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLXNC1O60486 1568 aa35.45■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP7AQ04656 1500 aa35.45■■■■□ 3.27
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.44■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.43■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.42■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.42■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.39■■■■□ 3.26
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.36■■■■□ 3.25
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.33■■■■□ 3.25
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.3■■■■□ 3.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCA6Q8N139 1617 aa35.28■■■■□ 3.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM52Q96A61 297 aa35.28■■■■□ 3.24
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.26■■■■□ 3.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.24■■■■□ 3.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.21■■■■□ 3.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERBINQ96RT1 1412 aa35.21■■■■□ 3.23
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A2MP01023 1474 aa35.17■■■■□ 3.22
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PZPP20742 1482 aa35.11■■■■□ 3.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP155O75694 1391 aa35.1■■■■□ 3.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UNC13BO14795 1591 aa35.1■■■■□ 3.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.09■■■■□ 3.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.09■■■■□ 3.21
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF3BO15066 747 aa35.09■■■■□ 3.21
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