RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281708.8

FBXW7-202, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 7, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXW7, Length 4,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW7-202ENST00000281708 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 NESP48681 1621 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 HMGXB3Q12766 1538 aa27.38■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.37■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 NEUROD2Q15784 382 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXW7-202ENST00000281708 SOX12O15370 315 aa27.32■■□□□ 1.96
FBXW7-202ENST00000281708 IFT140Q96RY7 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
FBXW7-202ENST00000281708 MORC1Q86VD1 984 aa27.29■■□□□ 1.96
FBXW7-202ENST00000281708 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
FBXW7-202ENST00000281708 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
FBXW7-202ENST00000281708 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
FBXW7-202ENST00000281708 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
FBXW7-202ENST00000281708 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
FBXW7-202ENST00000281708 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
FBXW7-202ENST00000281708 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
FBXW7-202ENST00000281708 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.16■■□□□ 1.94
FBXW7-202ENST00000281708 TOPBP1Q92547 1522 aa27.15■■□□□ 1.94
FBXW7-202ENST00000281708 NPHP1O15259 732 aa27.14■■□□□ 1.94
FBXW7-202ENST00000281708 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.11■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.1■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.09■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.09■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 UACAQ9BZF9 1416 aa27.08■■□□□ 1.93
FBXW7-202ENST00000281708 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 SYNJ2O15056 1496 aa27.03■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.03■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 MS4A1P11836 297 aa27.02■■□□□ 1.92
FBXW7-202ENST00000281708 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.99■■□□□ 1.91
FBXW7-202ENST00000281708 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.98■■□□□ 1.91
FBXW7-202ENST00000281708 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
FBXW7-202ENST00000281708 PRDM2Q13029 1718 aa26.98■■□□□ 1.91
FBXW7-202ENST00000281708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.96■■□□□ 1.91
FBXW7-202ENST00000281708 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.95■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 SYNJ1O43426 1573 aa26.94■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.94■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 CUX1P39880 1505 aa26.94■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 KIF15Q9NS87 1388 aa26.93■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 NUTM2FA1L443 756 aa26.92■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 RALBP1Q15311 655 aa26.92■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.91■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.9■■□□□ 1.9
FBXW7-202ENST00000281708 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 TOP2BQ02880 1626 aa26.87■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 CCER2I3L3R5 266 aa26.86■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 AFAP1Q8N556 730 aa26.86■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 CASC1Q6TDU7 716 aa26.84■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.84■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 AMPHP49418 695 aa26.84■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.83■■□□□ 1.89
FBXW7-202ENST00000281708 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.83■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 KIF21BO75037 1637 aa26.82■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.8■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 EVC2Q86UK5 1308 aa26.8■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.882e-6■■■■□ 20.5
FBXW7-202ENST00000281708 NCOA2Q15596 1464 aa26.79■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.77■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 STAC3Q96MF2 364 aa26.77■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.77■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.77■■□□□ 1.88
FBXW7-202ENST00000281708 PRXQ9BXM0 1461 aa26.75■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 GOLGA2Q08379 1002 aa26.75■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.74■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.74■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.71■■□□□ 1.87
FBXW7-202ENST00000281708 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.69■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 BECN1Q14457 450 aa26.68■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 NLRP13Q86W25 1043 aa26.68■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 COG3Q96JB2 828 aa26.68■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 ARAP1Q96P48 1450 aa26.67■■□□□ 1.86
FBXW7-202ENST00000281708 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms