RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 GGT6Q6P531 493 aa26.32■■□□□ 1.8
LRIG1-201ENST00000273261 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
LRIG1-201ENST00000273261 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
LRIG1-201ENST00000273261 RALBP1Q15311 655 aa26.31■■□□□ 1.8
LRIG1-201ENST00000273261 FOXD1Q16676 465 aa26.3■■□□□ 1.8
LRIG1-201ENST00000273261 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
LRIG1-201ENST00000273261 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.26■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 JPH4Q96JJ6 628 aa26.24■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 ARXQ96QS3 562 aa26.23■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.22■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 MLECQ14165 292 aa26.21■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 RGS3P49796 1198 aa26.21■■□□□ 1.79
LRIG1-201ENST00000273261 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
LRIG1-201ENST00000273261 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.18■■□□□ 1.78
LRIG1-201ENST00000273261 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.18■■□□□ 1.78
LRIG1-201ENST00000273261 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.782e-7■■□□□ 14.4
LRIG1-201ENST00000273261 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.16■■□□□ 1.78
LRIG1-201ENST00000273261 KIF3BO15066 747 aa26.15■■□□□ 1.78
LRIG1-201ENST00000273261 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 CFAP44Q96MT7 982 aa26.1■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 STK26Q9P289 416 aa26.1■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
LRIG1-201ENST00000273261 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.07■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 NCAPD3P42695 1498 aa26.05■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 IGF1RP08069 1367 aa26.05■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.03■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 PTPRGP23470 1445 aa26.03■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 NLRP13Q86W25 1043 aa26.02■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.02■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
LRIG1-201ENST00000273261 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.01■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.01■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.99■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 UACAQ9BZF9 1416 aa25.99■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 PDE3BQ13370 1112 aa25.98■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.97■■□□□ 1.75
LRIG1-201ENST00000273261 SOX12O15370 315 aa25.95■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 KIF15Q9NS87 1388 aa25.95■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 HSCBQ8IWL3 235 aa25.93■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 CUX1P39880 1505 aa25.93■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.91■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 MCCP23508 829 aa25.91■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 KCNJ4P48050 445 aa25.9■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA2Q08379 1002 aa25.89■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 EID1Q9Y6B2 187 aa25.87■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 FGD1P98174 961 aa25.87■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.86■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.84■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.83■■□□□ 1.73
LRIG1-201ENST00000273261 KIF21BO75037 1637 aa25.82■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.82■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.81■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.81■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 NPHP1O15259 732 aa25.81■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.79■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 USP47Q96K76 1375 aa25.77■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.77■■□□□ 1.72
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.76■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.75■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 STAC3Q96MF2 364 aa25.75■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 STK31Q9BXU1 1019 aa25.75■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.74■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.74■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 PANK3Q9H999 370 aa25.72■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 CFTRP13569 1480 aa25.72■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
LRIG1-201ENST00000273261 EVC2Q86UK5 1308 aa25.69■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.69■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.69■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 GRIN2BQ13224 1484 aa25.68■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.68■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.68■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 HMMRO75330 724 aa25.68■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 PTMSP20962 102 aa25.68■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 OSCARQ8IYS5 282 aa25.67■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.67■■□□□ 1.7
LRIG1-201ENST00000273261 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms