RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CD109Q6YHK3 1445 aa11.75□□□□□ -0.53
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SMARCE1-201ENST00000264640 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.73□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.73□□□□□ -0.53
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SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE6P0CI01 402 aa11.72□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.72□□□□□ -0.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNH8Q96L42 1107 aa11.71□□□□□ -0.53
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SMARCE1-201ENST00000264640 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.67□□□□□ -0.54
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.66□□□□□ -0.54
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SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.62□□□□□ -0.55
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SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.61□□□□□ -0.55
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SMARCE1-201ENST00000264640 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.53□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP10BO94823 1461 aa11.53□□□□□ -0.56
SMARCE1-201ENST00000264640 STRCQ7RTU9 1775 aa11.53□□□□□ -0.56
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SMARCE1-201ENST00000264640 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.52□□□□□ -0.57
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SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.47□□□□□ -0.57
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SMARCE1-201ENST00000264640 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.47□□□□□ -0.57
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SMARCE1-201ENST00000264640 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.38□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 C3P01024 1663 aa11.38□□□□□ -0.59
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SMARCE1-201ENST00000264640 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.37□□□□□ -0.59
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SMARCE1-201ENST00000264640 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.36□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.35□□□□□ -0.59
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP10AO60312 1499 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRTO14522 1441 aa11.33□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.32□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.32□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.3□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 CHADLQ6NUI6 762 aa11.3□□□□□ -0.6
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SMARCE1-201ENST00000264640 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA6Q8N139 1617 aa11.29□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR29P0C7W0 189 aa11.29□□□□□ -0.6
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SMARCE1-201ENST00000264640 NCOA1Q15788 1441 aa11.27□□□□□ -0.6
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF14Q15058 1648 aa11.27□□□□□ -0.61
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SMARCE1-201ENST00000264640 PLCH2O75038 1416 aa11.26□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.25□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 GABBR2O75899 941 aa11.24□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 REREQ9P2R6 1566 aa11.24□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.23□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.22□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.22□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.21□□□□□ -0.61
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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