RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262346.6

ANKRD13C-201, Transcript of ankyrin repeat domain 13C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD13C, Length 3,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13C-201ENST00000262346 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
ANKRD13C-201ENST00000262346 PKD2Q13563 968 aa15.32■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.29■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 HECW1Q76N89 1606 aa15.29■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 ABCC5O15440 1437 aa15.29■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.29■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 JPH4Q96JJ6 628 aa15.28■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 DAPK1P53355 1430 aa15.28■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.28■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.27■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 ERCC6Q03468 1493 aa15.27■□□□□ 0.04
ANKRD13C-201ENST00000262346 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.26■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC7Q96M83 1385 aa15.26■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ARHGEF11O15085 1522 aa15.25■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 MIA2Q96PC5 1412 aa15.25■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.25■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ADAMTS12P58397 1594 aa15.24■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 WDR62O43379 1518 aa15.24■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 PBRM1Q86U86 1689 aa15.24■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.23■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 10.8
ANKRD13C-201ENST00000262346 DISP1Q96F81 1524 aa15.23■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 RGL3Q3MIN7 710 aa15.23■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.22■□□□□ 0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.21■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 NUP155O75694 1391 aa15.2■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 TSPY4P0CV99 314 aa15.2■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 TSPY10P0CW01 314 aa15.2■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 MYT1Q01538 1121 aa15.2■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.19■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 IFT140Q96RY7 1462 aa15.19■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.19■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 GRIN2AQ12879 1464 aa15.18■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.17■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 NCOA1Q15788 1441 aa15.15■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 USP47Q96K76 1375 aa15.15■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIAA0556O60303 1618 aa15.15■□□□□ 0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.14■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.14■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 AKNAQ7Z591 1439 aa15.14■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 ROCK1Q13464 1354 aa15.14■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 TMC1Q8TDI8 760 aa15.13■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.13■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.13■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.12■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.11■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.1■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 PZPP20742 1482 aa15.1■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.1■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIF14Q15058 1648 aa15.09■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.08■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.07■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 MSH5O43196 834 aa15.07■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.06■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.06■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.05■□□□□ 0
ANKRD13C-201ENST00000262346 CEP170Q5SW79 1584 aa15.05■□□□□ -0
ANKRD13C-201ENST00000262346 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.04■□□□□ -0
ANKRD13C-201ENST00000262346 KIF15Q9NS87 1388 aa15.04■□□□□ -0
ANKRD13C-201ENST00000262346 SYNJ2O15056 1496 aa15.03■□□□□ -0
ANKRD13C-201ENST00000262346 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.03■□□□□ -0
ANKRD13C-201ENST00000262346 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
ANKRD13C-201ENST00000262346 ATP10BO94823 1461 aa15.02□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 PTPRGP23470 1445 aa15.01□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 MYT1LQ9UL68 1186 aa15□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.99□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 NUDCQ9Y266 331 aa14.96□□□□□ -0.01
ANKRD13C-201ENST00000262346 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.94□□□□□ -0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 NUP160Q12769 1436 aa14.91□□□□□ -0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.91□□□□□ -0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.9□□□□□ -0.02
ANKRD13C-201ENST00000262346 PLIN1O60240 522 aa14.89□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 PANK3Q9H999 370 aa14.89□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ADGRL2O95490 1459 aa14.88□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.88□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 MBD5Q9P267 1494 aa14.88□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.87□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 NBR1Q14596 966 aa14.87□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 AFAP1Q8N556 730 aa14.87□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.87□□□□□ -0.03
ANKRD13C-201ENST00000262346 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms