RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NEO1Q92859 1461 aa39.86■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 AKNAQ7Z591 1439 aa39.85■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOA2Q15596 1464 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEF3O95398 923 aa39.83■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.82■■■■□ 3.97
CAPNS1-201ENST00000246533 PREX2Q70Z35 1606 aa39.82■■■■□ 3.96
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.81■■■■□ 3.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.79■■■■□ 3.96
CAPNS1-201ENST00000246533 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CAPNS1-201ENST00000246533 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.74■■■■□ 3.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.72■■■■□ 3.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRL1O94910 1474 aa39.72■■■■□ 3.95
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.7■■■■□ 3.95
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.64■■■■□ 3.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.63■■■■□ 3.94
CAPNS1-201ENST00000246533 RICTORQ6R327 1708 aa39.6■■■■□ 3.93
CAPNS1-201ENST00000246533 AFAP1Q8N556 730 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.58■■■■□ 3.93
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC1P33527 1531 aa39.57■■■■□ 3.92
CAPNS1-201ENST00000246533 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.55■■■■□ 3.92
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.55■■■■□ 3.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.52■■■■□ 3.92
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.51■■■■□ 3.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-201ENST00000246533 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.41■■■■□ 3.9
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD5Q9P267 1494 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.38■■■■□ 3.9
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM5CP41229 1560 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.36■■■■□ 3.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MIA2Q96PC5 1412 aa39.36■■■■□ 3.89
CAPNS1-201ENST00000246533 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
CAPNS1-201ENST00000246533 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.26■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.25■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.25■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA6Q8N139 1617 aa39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.16■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.16■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP7AQ04656 1500 aa39.13■■■■□ 3.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP10AO60312 1499 aa39.13■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC5O15440 1437 aa39.09■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY4P0CV99 314 aa39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPY10P0CW01 314 aa39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DAPK1P53355 1430 aa39.03■■■■□ 3.84
CAPNS1-201ENST00000246533 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.01■■■■□ 3.84
CAPNS1-201ENST00000246533 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MLECQ14165 292 aa39.01■■■■□ 3.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.01■■■■□ 3.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
CAPNS1-201ENST00000246533 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.95■■■■□ 3.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRKQ15262 1439 aa38.94■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGAEP38570 1179 aa38.94■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.93■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.92■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 A2MP01023 1474 aa38.92■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 REREQ9P2R6 1566 aa38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.9■■■■□ 3.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.87■■■■□ 3.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.87■■■■□ 3.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PLXNC1O60486 1568 aa38.86■■■■□ 3.81
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.82■■■■□ 3.81
CAPNS1-201ENST00000246533 AGLP35573 1532 aa38.81■■■■□ 3.8
CAPNS1-201ENST00000246533 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MADDQ8WXG6 1647 aa38.78■■■■□ 3.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOA1Q15788 1441 aa38.78■■■■□ 3.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF15Q9NS87 1388 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF3BO15066 747 aa38.75■■■■□ 3.79
CAPNS1-201ENST00000246533 GGT6Q6P531 493 aa38.75■■■■□ 3.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.8 ms