RNA–Protein interactions for RNA: YKR077W

MSA2, Transcript of Putative transcriptional activator, yeast

Gene MSA2, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSA2	YKR077W	ELO2	P25358	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	SHP1	P34223	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	YEL057C	P39983	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MSA2	YKR077W	PET130	P47065	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	THP1	Q08231	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	ARG3	P05150	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	APE1	P14904	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	NDE1	P40215	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	IKS1	P47042	667 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	AIM22	P47051	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	YGL260W	P53056	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	CRZ1	P53968	678 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSA2	YKR077W	MRE11	P32829	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	BNA4	P38169	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MUM2	P38236	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	ESL1	P40456	1118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	TIP41	Q12199	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MRS3	P10566	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	CST26	P38226	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	IRC6	P43615	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
MSA2	YKR077W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RTP1	Q12751	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	SUC2	P00724	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	ERP2	P39704	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	VPS52	P39904	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	SLD5	Q03406	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	IVY1	Q04934	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	SEC39	Q12745	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	COR1	P07256	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YCR007C	P25354	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RGT1	P32862	1170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	DUG2	P38149	878 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	BNA5	Q05979	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	UTR4	P32626	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	PTR2	P32901	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MSN2	P33748	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	VID24	P38263	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MBB1	P39534	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MET18	P40469	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	TWF1	P53250	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	PHO92	Q06390	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	SYO1	Q07395	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RIM20	Q12033	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	ATG29	Q12092	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RAV1	P47104	1357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	NDC1	P32500	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	FRE1	P32791	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RTT101	P47050	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MRPL19	P53875	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	INH1	P01097	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	CMC1	P36064	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	GPI1	P53306	609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	JJJ1	P53863	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSA2	YKR077W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	MET17	P06106	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	PHO2	P07269	559 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	CKA1	P15790	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	EXO70	P19658	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	BUD14	P27637	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	GPI10	P30777	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	SEC66	P33754	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSA2	YKR077W	MDM31	P38880	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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