RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR047W	YKR047W	ATP23	P53722	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	EOS1	P53938	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	THP1	Q08231	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	NFI1	Q12216	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	CBP1	P07252	654 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	PPZ2	P33329	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ARA1	P38115	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	COS5	P47187	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	MMR1	Q06324	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	COS7	Q07788	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YKR047W	YKR047W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YKR047W	YKR047W	URA4	P20051	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	HEL1	P36113	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	PIM1	P36775	1133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	VPS41	P38959	992 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ACL4	Q03771	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ARP10	Q04549	284 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	MCP2	Q06567	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RDR1	Q08904	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RHO2	P06781	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	BRF1	P29056	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SWH1	P35845	1188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	BNA4	P38169	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YHR210C	P38893	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	VRG4	P40107	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	HXT9	P40885	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SLG1	P54867	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ORM2	Q06144	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	UAF30	Q08747	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RRI1	Q12468	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	EDE1	P34216	1381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	CLN1	P20437	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	COQ3	P27680	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	LAG1	P38703	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SER3	P40054	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SHR3	Q02774	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	VAM3	Q12241	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SKS1	Q12505	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	GAL4	P04386	881 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	PEP5	P12868	1029 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	CNA1	P23287	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	MMS4	P38257	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	POP2	P39008	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YJL132W	P47014	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	PKP2	P53170	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	SOL4	P53315	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	BUD32	P53323	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YKR047W	YKR047W	OSW1	Q08692	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	AEP3	Q12089	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	FRE7	Q12333	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR047W	YKR047W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ERG11	P10614	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SPO7	P18410	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MSP1	P28737	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	HIR2	P32480	875 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MSN2	P33748	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	VHC1	P38329	1120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	PHO90	P39535	881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	VPS25	P47142	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	DCS1	Q06151	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MED2	Q12124	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	HSP42	Q12329	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	BNR1	P40450	1375 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 149.4 ms