RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RKM3P38222 552 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SIP3P38717 1229 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YJL193WP39542 402 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C NOC2P39744 710 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C AFG3P39925 761 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YER130CP39959 443 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YIL169CP40442 995 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C VTC2P43585 828 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YNL092WP53934 400 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RAD33Q04231 177 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FUS2Q05670 677 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TLG2Q08144 397 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HFI1Q12060 488 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SNA3P14359 133 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RME1P32338 300 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SFP1P32432 683 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C UIP5P36137 443 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ERC1P38767 581 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C EAF5P39995 279 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C OSW7P43611 510 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MDR1P53258 950 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TOF1P53840 1238 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ARK1P53974 638 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SMC5Q08204 1093 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RTP1Q12751 981 aa2.4□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CDC5P32562 705 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C GDA1P32621 518 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YSC83P32792 385 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C COT1P32798 439 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C UBP13P38187 747 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RSC1P53236 928 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RTT102P53330 157 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C VPS72Q03388 795 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C COQ9Q05779 260 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CUR1Q06469 252 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YDL057WQ07379 328 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TCO89Q08921 799 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C HIF1Q12373 385 aa2.39□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C OM45P16547 393 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C BET2P20133 325 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RPC53P25441 422 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MRC1P25588 1096 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PSO2P30620 661 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C DGR2P32330 852 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MSS51P32335 436 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C DPH2P32461 534 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C HXT4P32467 576 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C DSS4P32601 143 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ADE17P38009 592 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C PSY4P38193 441 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MNN1P39106 762 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C RAD26P40352 1085 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TOS3P43637 560 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C AZR1P50080 613 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YGR237CP50089 785 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C VID30P53076 958 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CUL3P53202 744 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TAM41P53230 385 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YNL146WP53906 100 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ECM30Q06673 1274 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C THI73Q07904 523 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YOL075CQ08234 1294 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C IES4Q08561 116 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TMA16Q08687 178 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MED1Q12321 566 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa2.38□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C CLC1P17891 233 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ATP12P22135 325 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.37□□□□□ -2.03not detected
GCN4YEL009C RPC25P35718 212 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YET1P35723 206 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C KES1P35844 434 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C DRE2P36152 348 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C VID24P38263 362 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TVP23P38962 199 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ALD5P40047 520 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C LCB2P40970 561 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C TFG2P41896 400 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C YFL040WP43562 540 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C SGM1P47166 707 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C HLJ1P48353 224 aa2.37□□□□□ -2.03
GCN4YEL009C MNP1P53163 194 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
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