RNA–Protein interactions for RNA: YDL093W

PMT5, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT5	YDL093W	YCR015C	P25616	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ERV1	P27882	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
PMT5	YDL093W	MRPL40	P36534	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PKP1	P40530	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YFT2	Q06676	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	NUS1	Q12063	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	HER1	Q12276	1246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SWM1	Q12379	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YPT6	Q99260	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	GRR1	P24814	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	CLB3	P24870	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YCR061W	P25639	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PHO91	P27514	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	UBP11	P36026	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PEX32	P38292	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MUP3	P38734	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	AKR1	P39010	764 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
PMT5	YDL093W	PLB2	Q03674	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RIM20	Q12033	661 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SLM3	Q12093	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
PMT5	YDL093W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	CDC6	P09119	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MSP1	P28737	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	VID24	P38263	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YSW1	P38280	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ECM18	Q04623	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MRP4	P32902	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	COS111	P38308	924 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPP1	P38786	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YJL193W	P39542	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	INA22	P40576	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	BAP3	P41815	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MTL1	P53214	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ARP5	P53946	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ROY1	Q04847	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SEC39	Q12745	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RIM15	P43565	1770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	HIS5	P07172	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MRE11	P32829	692 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SRB2	P34162	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPC37	P36121	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MAL33	P38157	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	LCL3	P53153	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	BUD7	Q08754	746 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YRM1	Q12340	786 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	VPS34	P22543	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	REG2	P38232	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	RFC3	P38629	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YIL077C	P40508	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	IME4	P41833	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ALT2	P52892	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	HOP2	P53187	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YGR066C	P53242	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	HOF1	Q05080	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	HMI1	Q12039	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	VPS54	Q12071	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	SEC12	P11655	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	HMX1	P32339	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	DSS4	P32601	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	BCS1	P32839	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YJL206C	P39529	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	TMN3	P40071	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	ORC3	P54790	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMT5	YDL093W	INA17	Q02888	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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