RNA–Protein interactions for RNA: YDR288W

NSE3, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE3, Length 912 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	YDR288W	PIG1	Q06216	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	CNA1	P23287	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YCK1	P23291	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	VRG4	P40107	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	PKP1	P40530	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SMC3	P47037	1230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	APL4	Q12028	832 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SEM1	O94742	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	GAL4	P04386	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RPN12	P32496	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YKL050C	P35736	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	PXL1	P36166	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	ZDS2	P54786	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	VTC3	Q02725	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	INA17	Q02888	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	FRE3	Q08905	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	INP53	Q12271	1107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	CHO1	P08456	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	UIP3	P39547	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	ERP2	P39704	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YPT11	P48559	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	DIA3	P52290	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	COG4	Q06096	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	RRI2	Q12348	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	POL4	P25615	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YPT53	P36019	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	ARP9	Q05123	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	STE50	P25344	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	PEP3	P27801	918 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	IMP2'	P32351	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	STV1	P37296	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YML037C	Q03703	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	POS5	Q06892	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSE3	YDR288W	YPR089W	O13585	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ADH7	P25377	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	VPS41	P38959	992 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YTP1	P53584	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MCP2	Q06567	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ATX2	Q12067	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	HER1	Q12276	1246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RPB8	P20436	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YIR016W	P40572	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	PTR3	P43606	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	IRC8	P47046	822 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	LCL3	P53153	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ASI1	P54074	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YKU80	Q04437	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	AFT2	Q08957	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	RCN2	Q12044	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ATG9	Q12142	997 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MED1	Q12321	566 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YIH1	P25637	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	SPC97	P38863	823 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	FLC2	P39719	783 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	DSD1	P53095	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	YNL234W	P53857	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ARP10	Q04549	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	INH1	P01097	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	GCN4	P03069	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	CLB2	P24869	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	SGF29	P25554	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MGM1	P32266	881 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	MNN2	P38069	597 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	DBP8	P38719	431 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	ELO1	P39540	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE3	YDR288W	PCI8	P40512	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.5 ms