RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W RCY1P39531 840 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YIR042CP40586 236 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W BNA1P47096 177 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W COS5P47187 383 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HCA4P20448 770 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ECM14P38836 430 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HNT2P49775 206 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SEC5P89102 971 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YLR287CQ05881 355 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W BAG7Q12128 409 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ILV5P06168 395 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VHC1P38329 1120 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YGR153WP48238 217 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W GPI8P49018 411 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ISU1Q03020 165 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W KCS1Q12494 1050 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CDC4P07834 779 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DBF20P32328 564 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YHR054CP38780 354 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TAT2P38967 592 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W POP2P39008 433 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VRG4P40107 337 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RRN7P40992 514 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
SIN3YOL004W RPN14P53196 417 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RTC4P53850 401 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SPE4Q12455 300 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PCT1P13259 424 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SEC23P15303 768 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W EXO84P38261 753 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TDA3P38758 523 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CKB2P38930 258 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W XBP1P40489 647 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SPC98P53540 846 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YOR022CQ12204 715 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YLR122CQ12312 125 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TRK1P12685 1235 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W URA4P20051 364 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PPH22P23595 377 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MCM10P32354 571 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SPT20P50875 604 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SIW14P53965 281 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CTR9P89105 1077 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SIL1Q08199 421 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TAH18Q12181 623 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NUM1Q00402 2748 aa2.94□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DED1P06634 604 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RMA1P36001 430 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W FRT2P39734 528 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W JEM1P40358 645 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W AYR1P40471 297 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W QDR2P40474 542 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HOC1P47124 396 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ECL1P48235 211 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DAM1P53267 343 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RSC2Q06488 889 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TAZ1Q06510 381 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YPR027CQ12079 277 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NCP1P16603 691 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NPP1P25353 742 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SSE1P32589 693 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W KAP122P32767 1081 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VPS52P39904 641 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CUP9P41817 306 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W IRC6P43615 237 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HFM1P51979 1187 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RSC1P53236 928 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MFM1Q02783 413 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YDR514CQ04408 483 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CDD1Q06549 142 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HIM1Q06674 414 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W GPM2Q12008 311 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TPO4Q12256 659 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YDL177CQ12257 170 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YRO2P38079 344 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PCH2P38126 564 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CTP1P38152 299 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W AXL2P38928 823 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SER3P40054 469 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W POL31P46957 487 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W EEB1Q02891 456 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YPL277CQ08989 487 aa2.93□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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