RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	SAE2	P46946	345 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	UBX6	P47049	396 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	ATP23	P53722	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YAT1	P80235	687 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YDR109C	Q04585	715 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CRN1	Q06440	651 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SWA2	Q06677	668 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	FRE7	Q12333	620 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	KAR3	P17119	729 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YCK1	P23291	538 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	APD1	P38281	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YBR225W	P38321	900 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NPR2	P39923	615 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	TIM10	P87108	93 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	INA17	Q02888	182 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	TDA9	Q04545	1251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RAD34	Q06665	692 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CYK3	Q07533	885 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NMD4	Q12129	218 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	HUA2	Q12134	243 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PRE8	P23639	250 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	PTC6	P25646	442 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	GSH1	P32477	678 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YBL029W	P38201	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RTS1	P38903	757 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	FLC2	P39719	783 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	JHD1	P40034	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	XBP1	P40489	647 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CIR1	P42940	261 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	IRC6	P43615	237 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NGL3	Q03210	505 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SKG3	Q06315	1026 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CIR2	Q08822	631 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YPL272C	Q08984	517 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	TAH18	Q12181	623 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RTC1	Q08281	1341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MAK32	P23060	363 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	CDC15	P27636	974 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	LTP1	P40347	161 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	RMD8	P43620	662 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MRX6	P48564	524 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	DSD1	P53095	428 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	VPS75	P53853	264 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	FCP1	Q03254	732 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	MFB1	Q04922	465 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	ORM2	Q06144	216 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	BSP1	Q06604	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	IRC3	Q06683	689 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	YLR111W	Q12528	110 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA10	YHR039C-A	GCN4	P03069	281 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	PTP1	P25044	335 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	MAL33	P38157	468 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	UBP13	P38187	747 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	NMD5	P46970	1048 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	SGM1	P47166	707 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	MRPL19	P53875	158 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	YNL058C	P53947	316 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	AAT1	Q01802	451 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	RSM28	Q03430	361 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	TAF11	Q04226	346 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	CTI6	Q08923	506 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	SPE4	Q12455	300 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	FOB1	O13329	566 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	BI2	P03873	423 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	ECM10	P39987	644 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	MRX1	P40050	688 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	ASG1	P40467	964 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA10	YHR039C-A	CDC1	P40986	491 aa		3.32	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms