RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	TPO3	Q06451	622 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	BAG7	Q12128	409 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	SLC1	P33333	303 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	AXL2	P38928	823 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	UME6	P39001	836 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	PHM8	P40025	321 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	CIN1	P40987	1014 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	ASE1	P50275	885 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	YNL058C	P53947	316 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG34	YOL083W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	NMD5	P46970	1048 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	REG1	Q00816	1014 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	RSC9	Q03124	581 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	TMA16	Q08687	178 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	VCX1	Q99385	411 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.26	□□□□□ -1.73	not detected
ATG34	YOL083W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	CNS1	P33313	385 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	PSD1	P39006	500 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	YER010C	P40011	234 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	CDC1	P40986	491 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	YPR003C	P53394	754 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	THI3	Q07471	609 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	MDM10	P18409	493 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	RRN3	P36070	627 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	LTP1	P40347	161 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	RIC1	P40395	1056 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SNO3	P43544	222 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SWA2	Q06677	668 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SSH4	P32343	579 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	CBF2	P32504	956 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	XBP1	P40489	647 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	YNR061C	P53747	219 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SNO4	Q04902	237 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	HSP32	Q08992	237 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	YLR302C	O13544	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	TOP1	P04786	769 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ERG8	P24521	451 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	COQ3	P27680	312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	MRP20	P32387	263 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SRB5	P32585	307 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	FMP10	P40098	244 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SWP82	P43554	623 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	IRC7	P43623	340 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ORC5	P50874	479 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	VPS4	P52917	437 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	CRN1	Q06440	651 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	PFA4	Q12006	378 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	RER1	P25560	188 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	TFC3	P34111	1160 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	ASG1	P40467	964 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	MEP3	P53390	489 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG34	YOL083W	GAL4	P04386	881 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	UBP13	P38187	747 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	FCP1	Q03254	732 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	RCO1	Q04779	684 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	OPY2	Q06810	360 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	CRC1	Q12289	327 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	MSS51	P32335	436 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	MCM10	P32354	571 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	ARN1	P38731	627 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YJL107C	P42947	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	GPA1	P08539	472 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	OCT1	P35999	772 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG34	YOL083W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74

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