RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	SUE1	Q06524	206 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HFI1	Q12060	488 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	APM4	Q99186	491 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SPO16	P17122	198 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SED4	P25365	1065 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PTP2	P29461	750 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	UBP13	P38187	747 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CTF8	P38877	133 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	PZF1	P39933	429 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SDP1	P40479	209 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	FMS1	P50264	508 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	UBX4	P54730	416 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ORC3	P54790	616 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ERV41	Q04651	352 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	DON1	Q05610	365 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ARP6	Q12509	438 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	FLO11	P08640	1367 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YLR278C	Q05854	1341 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TRP3	P00937	484 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	FBP1	P09201	348 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	YML002W	P0CF17	737 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	CLN3	P13365	580 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	BUD14	P27637	709 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	SET3	P36124	751 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	HOT1	Q03213	719 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	MLC2	Q06580	163 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	TPO1	Q07824	586 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PSH1	YOL054W	GAL1	P04385	528 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	HEM15	P16622	393 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	KAR3	P17119	729 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	IME1	P21190	360 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	DBF4	P32325	704 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YSC83	P32792	385 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TRM2	P33753	639 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YBR032W	P38223	100 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	VHC1	P38329	1120 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MSG5	P38590	489 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	REV7	P38927	245 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YTA12	P40341	825 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YIL001W	P40560	513 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	AXL1	P40851	1208 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YGR111W	P53265	400 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SOL4	P53315	255 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SNO2	P53823	222 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ARK1	P53974	638 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TIM8	P57744	87 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MRPL25	P23369	157 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	NGG1	P32494	702 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.82	□□□□□ -1.48	not detected
PSH1	YOL054W	PTH2	P34222	208 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YBL028C	P38202	106 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	FZO1	P38297	855 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	HSM3	P38348	480 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	NDT80	P38830	627 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	VPS4	P52917	437 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	DIP5	P53388	608 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	HOL1	P53389	586 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ROT1	Q03691	256 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YDR278C	Q05612	105 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	OSW1	Q08692	278 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	PMS1	P14242	873 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	CBF1	P17106	351 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	MRE11	P32829	692 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YME2	P32843	850 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	TFC3	P34111	1160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	YKR073C	P36153	106 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	POP4	P38336	279 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
PSH1	YOL054W	YMR134W	P40207	237 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	ASG1	P40467	964 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PSH1	YOL054W	FIS1	P40515	155 aa		5.81	□□□□□ -1.48

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