RNA–Protein interactions for RNA: YDR107C

TMN2, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN2, Length 2,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN2	YDR107C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MAL33	P38157	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MAM1	P40065	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	BAP3	P41815	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	VPS62	P53285	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ERG5	P54781	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	CRF1	Q04930	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YEH1	Q07804	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	PUP2	P32379	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	REG2	P38232	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ZIM17	P42844	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	GYL1	Q04322	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	DUS4	Q06063	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	BUD7	Q08754	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	FRE6	Q12473	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YPT6	Q99260	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
TMN2	YDR107C	UBP11	P36026	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	CST26	P38226	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	NUP60	P39705	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	DOT5	P40553	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	IME4	P41833	600 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	THI6	P41835	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	SSU1	P41930	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	IMO32	P53219	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	FMP45	Q07651	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ESC8	Q08119	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RIM20	Q12033	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RPO31	P04051	1460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	VPS34	P22543	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	FKH2	P41813	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	SKP2	P42843	763 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	TCB2	P48231	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	CLB3	P24870	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	KAR4	P25583	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	EFM4	P40516	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YGR035C	P53222	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YAP6	Q03935	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	THI72	Q08579	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	REX3	Q12090	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	SWT1	Q12104	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MYO4	P32492	1471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YCR051W	P25631	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ERV1	P27882	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	SWC3	P31376	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MGM1	P32266	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MRPL7	P36519	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	VID24	P38263	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
TMN2	YDR107C	YGR130C	P53278	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YML037C	Q03703	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RSF1	Q05043	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	GPM3	Q12326	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
TMN2	YDR107C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	SRB5	P32585	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ICP55	P40051	511 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	YJL055W	P47044	245 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	ROY1	Q04847	553 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	IZH3	Q07959	543 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	TCO89	Q08921	799 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.4 ms