RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W TDA9Q04545 1251 aa3.81□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YFT2Q06676 274 aa3.81□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W NBP2Q12163 236 aa3.81□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W PCD1Q12524 340 aa3.81□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W FUR1P18562 216 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W VPS33P20795 691 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W APN1P22936 367 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YMC1P32331 307 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W NUP120P35729 1037 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YJL193WP39542 402 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W MIT1P40002 666 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YJR061WP40355 935 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W STB2P46679 850 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W IDS2P46958 469 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W MRPL19P53875 158 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YKU80Q04437 629 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W CIR2Q08822 631 aa3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W BIK1P11709 440 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W NTH1P32356 751 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W APL3P38065 1025 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W CTP1P38152 299 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W LRO1P40345 661 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W SKP2P42843 763 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W REG1Q00816 1014 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YLR287CQ05881 355 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W AIM6Q07716 390 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W ULA1Q12059 462 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YOR111WQ99210 232 aa3.79□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W ATP2P00830 511 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-FP0CX61 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-CP25383 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W SGF29P25554 259 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W SAC6P32599 642 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W DSS4P32601 143 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W IRC6P43615 237 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W MPS3P47069 682 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W NMA2P53204 395 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W FCP1Q03254 732 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-DR2Q03483 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W MFB1Q04922 465 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W HUA2Q12134 243 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-BQ12260 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-OR2Q12293 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W SUL2Q12325 893 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W SCM3Q12334 223 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-DR1Q12392 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-OR1Q12439 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W TY2A-DR3Q99303 438 aa3.78□□□□□ -1.8
SNX4YJL036W LAM4P38800 1345 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W PRE8P23639 250 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W MRP20P32387 263 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W TAX4P47030 604 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W COS12P53053 380 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W TAM41P53230 385 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W TAF11Q04226 346 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W ARR3Q06598 404 aa3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W GCN4P03069 281 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RED1P14291 827 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RGT1P32862 1170 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W PXA2P34230 853 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W YKL050CP35736 922 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W ESL2P36168 1195 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W YBR225WP38321 900 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W PMT6P42934 759 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RSC1P53236 928 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W YSA1Q01976 231 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W CRF1Q04930 467 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W VAM6Q07468 1049 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W ENT4Q07872 247 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W RKI1Q12189 258 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SNX4YJL036W TPK2P06245 380 aa3.75□□□□□ -1.81
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