RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pkd1l1Q8R526 2615 aa11.78□□□□□ -0.52
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uqcr11Q9CPX8 56 aa11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anapc11Q9CPX9 84 aa11.77□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nupr2Q497P3 102 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm16253D3Z167 63 aa11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AW011738F6S7Q2 159 aa11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndufs5Q99LY9 106 aa11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Muc6Q80T03 2850 aa11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cypt14J3QPF7 87 aa11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10065F6TJM2 114 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 OxtP35454 125 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stab2Q8R4U0 2559 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defb13Q8R2I4 64 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm4707V9GXN5 68 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9821Q8K076 103 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dync2h1Q45VK7 4306 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap29-1A2A5X4 342 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17349F7BGH6 99 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defb11Q8R2I7 77 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Adm2Q7TNK8 150 aa11.59□□□□□ -0.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa11.53□□□□□ -0.56
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cypt15B1AXS0 87 aa11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10999F6Q4M4 69 aa11.51□□□□□ -0.57
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defb39Q70KL3 74 aa11.5□□□□□ -0.57
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PrkdcP97313 4128 aa11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa11.41□□□□□ -0.58
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q8BGJ3 129 aa11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Defb1P56386 69 aa11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wfdc3Q14AE4 130 aa11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2310034C09RikQ9D746 214 aa11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fras1Q80T14 4010 aa11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnp2P11378 117 aa11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap14O08640 167 aa11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Spaca4Q80ZQ0 127 aa11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnah5Q8VHE6 4621 aa11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hectd4E9Q2E4 4418 aa11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9507D3Z5T3 223 aa11.31□□□□□ -0.6
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap13O88375 197 aa11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pla2g10Q9QXX3 151 aa11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnah2P0C6F1 4456 aa11.17□□□□□ -0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9918Q8BUR5 174 aa11.16□□□□□ -0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa11.15□□□□□ -0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vps13dB1ART2 4390 aa11.15□□□□□ -0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stard9Q80TF6 4561 aa11.13□□□□□ -0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap3-2Q9D638 99 aa11.13□□□□□ -0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa11.13□□□□□ -0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm12216A0A1W2P827 62 aa11.1□□□□□ -0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa11.06□□□□□ -0.64
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 A930033H14RikG5E8X6 103 aa11.05□□□□□ -0.64
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa11.04□□□□□ -0.64
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap10-4Q08EG8 221 aa11.03□□□□□ -0.64
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa11.02□□□□□ -0.65
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pkd1O08852 4293 aa10.99□□□□□ -0.65
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrp1bQ9JI18 4599 aa10.97□□□□□ -0.65
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm4491E0CX42 125 aa10.93□□□□□ -0.66
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm20537G3UYK7 97 aa10.89□□□□□ -0.67
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ApobE9Q414 4505 aa10.88□□□□□ -0.67
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa10.86□□□□□ -0.67
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa10.82□□□□□ -0.68
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pkhd1E9PZ36 4059 aa10.82□□□□□ -0.68
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ryr3A2AGL3 4863 aa10.8□□□□□ -0.68
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cox6b2Q80ZN9 88 aa10.69□□□□□ -0.7
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11939A2A592 99 aa10.64□□□□□ -0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SacsQ9JLC8 4582 aa10.61□□□□□ -0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CriptO70333 101 aa10.6□□□□□ -0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Romo1P60603 79 aa10.58□□□□□ -0.72
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm2696A0A1W2P709 240 aa10.57□□□□□ -0.72
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fat2Q5F226 4351 aa10.53□□□□□ -0.72
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ryr1E9PZQ0 5035 aa10.53□□□□□ -0.72
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm20538F6Z9R1 75 aa10.51□□□□□ -0.73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mp68P56379 58 aa10.51□□□□□ -0.73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rps29P62274 56 aa10.5□□□□□ -0.73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9955Q8CEJ8 102 aa10.44□□□□□ -0.74
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vps13bQ80TY5 3993 aa10.44□□□□□ -0.74
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa10.43□□□□□ -0.74
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RetnlbQ99P86 105 aa10.39□□□□□ -0.75
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10382Q3V0T5 144 aa10.38□□□□□ -0.75
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa10.25□□□□□ -0.77
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpl37Q9D823 97 aa10.25□□□□□ -0.77
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17606F6ZL36 78 aa10.24□□□□□ -0.77
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa10.2□□□□□ -0.78
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa10.11□□□□□ -0.79
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rnase13Q5GAM7 153 aa10.1□□□□□ -0.79
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm21887J3QQ04 176 aa10□□□□□ -0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap3-1A2A591 98 aa9.97□□□□□ -0.81
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnah8Q91XQ0 4731 aa9.96□□□□□ -0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa9.94□□□□□ -0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Herc2Q4U2R1 4836 aa9.94□□□□□ -0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fat3Q8BNA6 4555 aa9.92□□□□□ -0.82
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abca13Q5SSE9 5034 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.8 ms