Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21887J3QQ04 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21887J3QQ04 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21887J3QQ04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21887J3QQ04 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21887J3QQ04 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21887J3QQ04 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21887J3QQ04 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21887J3QQ04 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm21887J3QQ04 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm21887J3QQ04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21887J3QQ04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21887J3QQ04 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21887J3QQ04 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21887J3QQ04 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21887J3QQ04 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21887J3QQ04 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21887J3QQ04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21887J3QQ04 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21887J3QQ04 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21887J3QQ04 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21887J3QQ04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21887J3QQ04 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21887J3QQ04 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21887J3QQ04 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21887J3QQ04 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21887J3QQ04 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21887J3QQ04 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21887J3QQ04 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21887J3QQ04 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21887J3QQ04 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21887J3QQ04 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21887J3QQ04 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21887J3QQ04 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21887J3QQ04 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21887J3QQ04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm21887J3QQ04 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21887J3QQ04 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21887J3QQ04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21887J3QQ04 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21887J3QQ04 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21887J3QQ04 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21887J3QQ04 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21887J3QQ04 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21887J3QQ04 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21887J3QQ04 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21887J3QQ04 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21887J3QQ04 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21887J3QQ04 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21887J3QQ04 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21887J3QQ04 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21887J3QQ04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21887J3QQ04 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21887J3QQ04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21887J3QQ04 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21887J3QQ04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21887J3QQ04 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21887J3QQ04 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21887J3QQ04 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21887J3QQ04 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21887J3QQ04 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21887J3QQ04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21887J3QQ04 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21887J3QQ04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21887J3QQ04 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21887J3QQ04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21887J3QQ04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21887J3QQ04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21887J3QQ04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21887J3QQ04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21887J3QQ04 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21887J3QQ04 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21887J3QQ04 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21887J3QQ04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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