RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb10Q8R2I8 73 aa11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spata3Q9D9T6 193 aa11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd164Q9R0L9 197 aa11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hivep1Q03172 2688 aa11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11627A6PWP4 55 aa11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AW011738F6S7Q2 159 aa11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah3Q8BW94 4083 aa11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7137J3QMW1 236 aa11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa25Q5G864 92 aa11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm16485Q8C4B7 115 aa11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SmcpP15265 143 aa11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sprr1aQ62266 144 aa11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ApcQ61315 2845 aa11.86□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PkigO70139 76 aa11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P01821 116 aa11.85□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa16P50714 93 aa11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa11.84□□□□□ -0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sslp1Q3UN54 99 aa11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa11.83□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtprqP0C5E4 2300 aa11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pou2af1Q64693 256 aa11.82□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serp2Q6TAW2 65 aa11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dmac1Q9CQ00 111 aa11.8□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cystm1Q8K353 104 aa11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prol1E9PYQ4 312 aa11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc6bF6ULY1 148 aa11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vpreb2P13373 142 aa11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P84750 121 aa11.76□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam19a1Q7TPG8 133 aa11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndufc1Q9CQY9 76 aa11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smim20D3Z7Q2 69 aa11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb37Q7TMD2 62 aa11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah6E9Q0B6 4144 aa11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smim29Q8R043 75 aa11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MplkipQ9D011 178 aa11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sfta2E9PXB6 77 aa11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah17Q69Z23 4481 aa11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa11.72□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sprr2jO70561 109 aa11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 D130052B06RikQ3UW13 202 aa11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa11.71□□□□□ -0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem243B2RVB9 118 aa11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Obox2E9PXV9 151 aa11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Notch1Q01705 2531 aa11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa11.7□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scgb1b2O35176 93 aa11.69□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GhrhP16043 103 aa11.68□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah10D3YYQ8 4591 aa11.67□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ScxQ64124 207 aa11.66□□□□□ -0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnah1E9Q8T7 4250 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11011D3Z3L9 86 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cox6a2P43023 97 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa7P50705 93 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam168bQ80XQ8 194 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17689B3GLJ4 109 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa4P28311 92 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col6a5A6H584 2640 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3618D3Z4P5 127 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm2916Q9D9B9 127 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igsf10Q3V1M1 2594 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 VwfQ8CIZ8 2813 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BaalcQ8VHV1 145 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Naa38Q9D2U5 125 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A0A286YE02 88 aa11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam104aA2A6P4 185 aa11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 P06320 134 aa11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem258P61166 79 aa11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 U90926O08546 118 aa11.59□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B9d2Q3UK10 175 aa11.59□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm12353A2AGJ4 60 aa11.58□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam19a5Q91WE9 132 aa11.58□□□□□ -0.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vpreb1P13372 142 aa11.58□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SvipQ3UZP4 77 aa11.58□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa11.57□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm20726G3UX18 150 aa11.57□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam229bQ8CF36 80 aa11.57□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vpreb3D3Z6J4 130 aa11.56□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 A330070K13RikQ8CA53 115 aa11.56□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa11.55□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa21Q8C1P2 93 aa11.55□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10401E9Q3K6 71 aa11.54□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zcchc13Q9D548 170 aa11.54□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm37013Q8K491 104 aa11.54□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PscaP57096 123 aa11.52□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb40Q70KL2 73 aa11.52□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam19a3Q7TPG6 132 aa11.52□□□□□ -0.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps28P62858 69 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defa23Q5G866 93 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.4 ms