RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C FRD1P32614 470 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C FPR3P38911 411 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C NUG1P40010 520 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C DOT6P40059 670 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YJR039WP47107 1121 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YNL018CP53976 612 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C ERO1Q03103 563 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C TRS23Q03784 219 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C BSP1Q06604 576 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C DCS2Q12123 353 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YOR131CQ12486 218 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SAC3P46674 1301 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PET127P32606 800 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.64□□□□□ -1.99not detected
GCN4YEL009C ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RTT107P38850 1070 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C COQ6P53318 479 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C ATG33Q06485 197 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C THI3Q07471 609 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C HER1Q12276 1246 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GRX6Q12438 231 aa2.64□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C TOP1P04786 769 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C FRS1P15624 595 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PCL2P25693 308 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C KRE2P27809 442 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SPL2P38839 148 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C NUP82P40368 713 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RPT4P53549 437 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YDL073WQ07454 984 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C VHS3Q08438 674 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YOL098CQ12496 1037 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C NCB2Q92317 146 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PMD1P32634 1753 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C ADR1P07248 1323 aa2.63□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YER190C-BP0CX94 160 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YEL077W-AP0CX95 160 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YGR296C-BP0CX96 160 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YPL283W-BP0CX97 160 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YPR204C-AP0CX98 160 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C WHI2P12611 486 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SEC18P18759 758 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C CNE1P27825 502 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YKU70P32807 602 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C ATO2P32907 282 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PCM1P38628 557 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SHC1P39000 512 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C EXO1P39875 702 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C BUD6P41697 788 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YJL043WP47053 257 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C NNF1P47149 201 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YGL260WP53056 76 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YIP4P53093 235 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SQS1P53866 767 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C UBX2Q04228 584 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GIN4Q12263 1142 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YLR111WQ12528 110 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C POM152P39685 1337 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PDR18P53756 1333 aa2.62□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C LCB1P25045 558 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RFC1P38630 861 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YGL242CP53066 181 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C MLC1P53141 149 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YNL193WP53870 558 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C IRC4Q03036 179 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RPN4Q03465 531 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C COG8Q04632 607 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C NKP2Q06162 153 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RRI2Q12348 645 aa2.61□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C FIG2P25653 1609 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PIF1P07271 859 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C CDC16P09798 840 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SFL1P20134 766 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C MSM1P22438 575 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C MSH2P25847 964 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C MRPL7P36519 292 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YBR139WP38109 508 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C BEM4P39011 633 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C TMN3P40071 706 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C CFD1P40558 293 aa2.6□□□□□ -1.99
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