RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 RYR3Q15413 4870 aa-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 RYR2Q92736 4967 aa-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 COL12A1Q99715 3063 aa-0.88□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA6Q8N139 1617 aa-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.89□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 PDCD5O14737 125 aa-0.9□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.91□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 GLI2P10070 1586 aa-0.91□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 M0R1W7 72 aa-0.92□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 EFCAB5A4FU69 1503 aa-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 M0QY20 66 aa-0.93□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.94□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 EEA1Q15075 1411 aa-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.95□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.96□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 K7EMI3 77 aa-0.96□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.97□□□□□ -2.56
SPTAN1-232ENST00000636483 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-0.98□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1XP80297 61 aa-0.98□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 ABRACLQ9P1F3 81 aa-0.98□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.98□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-0.99□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.99□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.99□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-1□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 M0QZ58 72 aa-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 LRBAP50851 2863 aa-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF21BO75037 1637 aa-1.01□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01546A6NGU7 62 aa-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 NMES1Q9C002 83 aa-1.02□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 LMO7Q8WWI1 1683 aa-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1EP04732 61 aa-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-1.03□□□□□ -2.57
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 IGIPA6NJ69 53 aa-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 A8MTW9 85 aa-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 SERF2P84101 59 aa-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 CPS1P31327 1500 aa-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.05□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-1.06□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A087WWC5 75 aa-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1LQ93083 61 aa-1.07□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.08□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 CSMD2Q7Z408 3487 aa-1.09□□□□□ -2.58
SPTAN1-232ENST00000636483 PRXQ9BXM0 1461 aa-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 MROH2AA6NES4 1674 aa-1.1□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1GP13640 62 aa-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 S100ZQ8WXG8 99 aa-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 AGLP35573 1532 aa-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.11□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 SYCP2Q9BX26 1530 aa-1.12□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 IQGAP1P46940 1657 aa-1.14□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 H0YGX0 51 aa-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 TFF3Q07654 80 aa-1.15□□□□□ -2.59
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-1.16□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 SMIM5Q71RC9 77 aa-1.17□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB4AO15263 64 aa-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 PLNP26678 52 aa-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB131AP59861 70 aa-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 LEAP2Q969E1 77 aa-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1-232ENST00000636483 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.22□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.22□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 NFAT5O94916 1531 aa-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCC8Q09428 1581 aa-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 MT2AP02795 61 aa-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 MT1MQ8N339 61 aa-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 ITPR2Q14571 2701 aa-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 CLTCL1P53675 1640 aa-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 ADCY10Q96PN6 1610 aa-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 ATMQ13315 3056 aa-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1-232ENST00000636483 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 SMIM2Q9BVW6 85 aa-1.29□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-1.3□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB136Q30KP8 78 aa-1.31□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 CFAP54Q96N23 3096 aa-1.32□□□□□ -2.62
SPTAN1-232ENST00000636483 TRPM2O94759 1503 aa-1.33□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms