RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 LAMA1P25391 3075 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 C5orf42Q9H799 3197 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 H3BNG1 76 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 ABRACLQ9P1F3 81 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.04□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.03□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 MT1AP04731 61 aa0.03□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
USP15-218ENST00000552346 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 TRPM2O94759 1503 aa0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 C9orf92A6NGG3 77 aa0.02□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 DEFB106AQ8N104 65 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 FAT1Q14517 4588 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 MUC17Q685J3 4493 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 CLTCL1P53675 1640 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 LAMA3Q16787 3333 aa0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 VPS13CQ709C8 3753 aa0.01□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 DMDP11532 3685 aa0□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 H3BUA1 57 aa0□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 NDUFA1O15239 70 aa0□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 SPRR2FQ96RM1 72 aa0□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 KAAG1Q9UBP8 84 aa0□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 TRIOO75962 3097 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.01□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 MROH2BQ7Z745 1585 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 ITPR2Q14571 2701 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 MUC2Q02817 5179 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 A8MTW9 85 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 M0QZ58 72 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP15-218ENST00000552346 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.03□□□□□ -2.41
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USP15-218ENST00000552346 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 M0QY20 66 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 TNP1P09430 55 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.04□□□□□ -2.42
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USP15-218ENST00000552346 MUC3AQ02505 3323 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 FRYLO94915 3013 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.06□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
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USP15-218ENST00000552346 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.06□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.06□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-0.06□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 MT1HP80294 61 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.07□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 SZT2Q5T011 3432 aa-0.08□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 MT4P47944 62 aa-0.08□□□□□ -2.42
USP15-218ENST00000552346 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.08□□□□□ -2.42
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