RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LINC00313P59037 77 aa2.72□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.72□□□□□ -1.97
TRDN-204ENST00000542443 ACYP2P14621 99 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.71□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 TENM2Q9NT68 2774 aa2.7□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 LINC01554Q52M75 96 aa2.7□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 PCOTHQ58A44 107 aa2.7□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.7□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP5-8O75690 187 aa2.69□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
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TRDN-204ENST00000542443 KRTAP10-10P60014 251 aa2.68□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 TENM3Q9P273 2699 aa2.68□□□□□ -1.98
TRDN-204ENST00000542443 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
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TRDN-204ENST00000542443 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.66□□□□□ -1.98
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TRDN-204ENST00000542443 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.64□□□□□ -1.99
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GU69 56 aa2.64□□□□□ -1.99
TRDN-204ENST00000542443 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.64□□□□□ -1.99
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TRDN-204ENST00000542443 APLNQ9ULZ1 77 aa2.63□□□□□ -1.99
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TRDN-204ENST00000542443 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.49□□□□□ -2.01
TRDN-204ENST00000542443 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.49□□□□□ -2.01
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GU33 70 aa2.48□□□□□ -2.01
TRDN-204ENST00000542443 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.48□□□□□ -2.01
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TRDN-204ENST00000542443 SPINK1P00995 79 aa2.47□□□□□ -2.01
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TRDN-204ENST00000542443 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.46□□□□□ -2.02
TRDN-204ENST00000542443 K7ERS5 55 aa2.45□□□□□ -2.02
TRDN-204ENST00000542443 P0C880 135 aa2.45□□□□□ -2.02
TRDN-204ENST00000542443 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.45□□□□□ -2.02
TRDN-204ENST00000542443 PKD1P98161 4303 aa2.45□□□□□ -2.02
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TRDN-204ENST00000542443 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.35□□□□□ -2.03
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TRDN-204ENST00000542443 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 MUC2Q02817 5179 aa2.31□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 RNF213Q63HN8 5207 aa2.31□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 R4GN34 69 aa2.3□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 S4R3F8 94 aa2.3□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 MYCBP2O75592 4640 aa2.3□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP12-1P59990 96 aa2.29□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 CRIPTQ9P021 101 aa2.29□□□□□ -2.04
TRDN-204ENST00000542443 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
TRDN-204ENST00000542443 M0QZ58 72 aa2.27□□□□□ -2.05
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