RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 VPS13CQ709C8 3753 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-213ENST00000489895 INE1O15225 51 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-213ENST00000489895 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-213ENST00000489895 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-213ENST00000489895 LCE3AQ5TA76 89 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-213ENST00000489895 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-213ENST00000489895 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-213ENST00000489895 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NISCH-213ENST00000489895 AKAP9Q99996 3911 aa7.09□□□□□ -1.27
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.09□□□□□ -1.28
NISCH-213ENST00000489895 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-213ENST00000489895 MT1HP80294 61 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-213ENST00000489895 DNAH2Q9P225 4427 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-213ENST00000489895 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.03□□□□□ -1.28
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.01□□□□□ -1.29
NISCH-213ENST00000489895 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NISCH-213ENST00000489895 DNHD1Q96M86 4753 aa6.98□□□□□ -1.29
NISCH-213ENST00000489895 MT2AP02795 61 aa6.93□□□□□ -1.3
NISCH-213ENST00000489895 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
NISCH-213ENST00000489895 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.93□□□□□ -1.3
NISCH-213ENST00000489895 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.89□□□□□ -1.31
NISCH-213ENST00000489895 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.85□□□□□ -1.31
NISCH-213ENST00000489895 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NISCH-213ENST00000489895 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.78□□□□□ -1.32
NISCH-213ENST00000489895 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.78□□□□□ -1.32
NISCH-213ENST00000489895 MT1FP04733 61 aa6.76□□□□□ -1.33
NISCH-213ENST00000489895 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.75□□□□□ -1.33
NISCH-213ENST00000489895 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.74□□□□□ -1.33
NISCH-213ENST00000489895 FAT1Q14517 4588 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-213ENST00000489895 RYR1P21817 5038 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-5P60370 271 aa6.61□□□□□ -1.35
NISCH-213ENST00000489895 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.57□□□□□ -1.36
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.57□□□□□ -1.36
NISCH-213ENST00000489895 ANK2Q01484 3957 aa6.57□□□□□ -1.36
NISCH-213ENST00000489895 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NISCH-213ENST00000489895 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NISCH-213ENST00000489895 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.5□□□□□ -1.37
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.49□□□□□ -1.37
NISCH-213ENST00000489895 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.48□□□□□ -1.37
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.48□□□□□ -1.37
NISCH-213ENST00000489895 RYR3Q15413 4870 aa6.47□□□□□ -1.37
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.46□□□□□ -1.38
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
NISCH-213ENST00000489895 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.4□□□□□ -1.38
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.4□□□□□ -1.39
NISCH-213ENST00000489895 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-213ENST00000489895 KMT2AQ03164 3969 aa6.38□□□□□ -1.39
NISCH-213ENST00000489895 RYR2Q92736 4967 aa6.37□□□□□ -1.39
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.37□□□□□ -1.39
NISCH-213ENST00000489895 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.34□□□□□ -1.39
NISCH-213ENST00000489895 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.28□□□□□ -1.4
NISCH-213ENST00000489895 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.22□□□□□ -1.41
NISCH-213ENST00000489895 LYSTQ99698 3801 aa6.21□□□□□ -1.42
NISCH-213ENST00000489895 MT1XP80297 61 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-213ENST00000489895 HERC1Q15751 4861 aa6.2□□□□□ -1.42
NISCH-213ENST00000489895 MT1BP07438 61 aa6.19□□□□□ -1.42
NISCH-213ENST00000489895 MYCBP2O75592 4640 aa6.18□□□□□ -1.42
NISCH-213ENST00000489895 HSPG2P98160 4391 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-213ENST00000489895 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.14□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 LCE2CQ5TA81 110 aa6.14□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 SPRR2EP22531 72 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 SPRR2BP35325 72 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 SPRR2AP35326 72 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.12□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-213ENST00000489895 HERC2O95714 4834 aa6.08□□□□□ -1.44
NISCH-213ENST00000489895 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.07□□□□□ -1.44
NISCH-213ENST00000489895 PKD1P98161 4303 aa6□□□□□ -1.45
NISCH-213ENST00000489895 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.98□□□□□ -1.45
NISCH-213ENST00000489895 MT1GP13640 62 aa5.97□□□□□ -1.45
NISCH-213ENST00000489895 SPRR2DP22532 72 aa5.93□□□□□ -1.46
NISCH-213ENST00000489895 LCE2BO14633 110 aa5.93□□□□□ -1.46
NISCH-213ENST00000489895 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.9□□□□□ -1.46
NISCH-213ENST00000489895 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.88□□□□□ -1.47
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.86□□□□□ -1.47
NISCH-213ENST00000489895 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-213ENST00000489895 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-213ENST00000489895 LRP2P98164 4655 aa5.83□□□□□ -1.48
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP12-4P60329 112 aa5.82□□□□□ -1.48
NISCH-213ENST00000489895 LCE3BQ5TA77 95 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.72□□□□□ -1.49
NISCH-213ENST00000489895 PKHD1P08F94 4074 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-213ENST00000489895 MT1LQ93083 61 aa5.63□□□□□ -1.51
NISCH-213ENST00000489895 MT1EP04732 61 aa5.61□□□□□ -1.51
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.61□□□□□ -1.51
NISCH-213ENST00000489895 MUC17Q685J3 4493 aa5.6□□□□□ -1.51
NISCH-213ENST00000489895 LPAP08519 4548 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-213ENST00000489895 TNXBP22105 4242 aa5.58□□□□□ -1.52
NISCH-213ENST00000489895 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
NISCH-213ENST00000489895 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.55□□□□□ -1.52
NISCH-213ENST00000489895 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
NISCH-213ENST00000489895 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
NISCH-213ENST00000489895 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
NISCH-213ENST00000489895 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.47□□□□□ -1.53
NISCH-213ENST00000489895 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.47□□□□□ -1.53
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.46□□□□□ -1.53
NISCH-213ENST00000489895 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.8 ms