RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 RYR2Q92736 4967 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 ROMO1P60602 79 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 RYR3Q15413 4870 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 P0C880 135 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-211ENST00000486161 RYR1P21817 5038 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-211ENST00000486161 H0YAA0 97 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-211ENST00000486161 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRD-211ENST00000486161 LUZP6Q538Z0 58 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 LYSTQ99698 3801 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 TNP1P09430 55 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 PRAC1Q96KF2 57 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRD-211ENST00000486161 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-211ENST00000486161 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-211ENST00000486161 A6NN06 94 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-211ENST00000486161 HERC2O95714 4834 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRD-211ENST00000486161 PKHD1P08F94 4074 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-211ENST00000486161 PKD1P98161 4303 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-211ENST00000486161 HSPG2P98160 4391 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-211ENST00000486161 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP12-2P59991 146 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP12-1P59990 96 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRD-211ENST00000486161 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-211ENST00000486161 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.74□□□□□ -1.81
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PTPRD-211ENST00000486161 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRD-211ENST00000486161 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.65□□□□□ -1.83
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PTPRD-211ENST00000486161 MT2AP02795 61 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-211ENST00000486161 HERC1Q15751 4861 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRD-211ENST00000486161 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRD-211ENST00000486161 TNXBP22105 4242 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRD-211ENST00000486161 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP12-3P60328 96 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-211ENST00000486161 RNF213Q63HN8 5207 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-211ENST00000486161 LCE3AQ5TA76 89 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRD-211ENST00000486161 MUC17Q685J3 4493 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-211ENST00000486161 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRD-211ENST00000486161 MT1BP07438 61 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRD-211ENST00000486161 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRD-211ENST00000486161 MT1XP80297 61 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-211ENST00000486161 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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PTPRD-211ENST00000486161 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRD-211ENST00000486161 INE1O15225 51 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRD-211ENST00000486161 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 SPRR2EP22531 72 aa3□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 SPRR2BP35325 72 aa3□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 SPRR2AP35326 72 aa3□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 LCE3CQ5T5A8 94 aa3□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRD-211ENST00000486161 MT1GP13640 62 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRD-211ENST00000486161 SPRR2DP22532 72 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRD-211ENST00000486161 MT1EP04732 61 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.88□□□□□ -1.95
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