RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-210ENST00000437078 J3QL48 77 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-210ENST00000437078 P0C880 135 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGEF1-210ENST00000437078 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGEF1-210ENST00000437078 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PKD1P98161 4303 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.21□□□□□ -1.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-210ENST00000437078 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-210ENST00000437078 RYR3Q15413 4870 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-210ENST00000437078 RYR1P21817 5038 aa7.17□□□□□ -1.26
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RABGEF1-210ENST00000437078 XP32Q5T750 250 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-210ENST00000437078 S4R3F8 94 aa7.09□□□□□ -1.27
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RABGEF1-210ENST00000437078 H0YAA0 97 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-210ENST00000437078 PLAC4Q8WY50 150 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-210ENST00000437078 MT1HL1P0DM35 61 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-210ENST00000437078 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPG2P98160 4391 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-210ENST00000437078 LRP2P98164 4655 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-210ENST00000437078 TPRXLQ17RH7 258 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-210ENST00000437078 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGEF1-210ENST00000437078 M0QZ58 72 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGEF1-210ENST00000437078 R4GN34 69 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.71□□□□□ -1.33
RABGEF1-210ENST00000437078 M0R2T5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGEF1-210ENST00000437078 HERC2O95714 4834 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGEF1-210ENST00000437078 TNXBP22105 4242 aa6.65□□□□□ -1.35
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP12-2P59991 146 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC2Q02817 5179 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-210ENST00000437078 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-210ENST00000437078 HERC1Q15751 4861 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP12-1P59990 96 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF213Q63HN8 5207 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PP632Q6XCG6 107 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGEF1-210ENST00000437078 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-210ENST00000437078 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-210ENST00000437078 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-210ENST00000437078 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-210ENST00000437078 TNP1P09430 55 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP10-10P60014 251 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-210ENST00000437078 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC17Q685J3 4493 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-210ENST00000437078 INE1O15225 51 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-210ENST00000437078 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.89□□□□□ -1.47
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RABGEF1-210ENST00000437078 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGEF1-210ENST00000437078 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-210ENST00000437078 LCE2CQ5TA81 110 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-210ENST00000437078 MT1FP04733 61 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGEF1-210ENST00000437078 MT2AP02795 61 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-210ENST00000437078 USH2AO75445 5202 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-210ENST00000437078 LCE3AQ5TA76 89 aa5.64□□□□□ -1.51
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RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP10-12P60413 245 aa5.47□□□□□ -1.53
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RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.33□□□□□ -1.56
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RABGEF1-210ENST00000437078 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGEF1-210ENST00000437078 SSPOA2VEC9 5147 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-210ENST00000437078 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-210ENST00000437078 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-210ENST00000437078 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-210ENST00000437078 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.72□□□□□ -1.65
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