RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BNG1 76 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGEF1-202ENST00000380828 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAC4Q8WY50 150 aa3.57□□□□□ -1.84
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.54□□□□□ -1.84
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RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.52□□□□□ -1.85
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.43□□□□□ -1.86
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1-202ENST00000380828 S4R3F8 94 aa3.37□□□□□ -1.87
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.34□□□□□ -1.88
RABGEF1-202ENST00000380828 INE1O15225 51 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-202ENST00000380828 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-202ENST00000380828 FAT1Q14517 4588 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-2P60368 255 aa3.29□□□□□ -1.88
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RABGEF1-202ENST00000380828 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-1P60331 282 aa3.25□□□□□ -1.89
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP12-1P59990 96 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGEF1-202ENST00000380828 Q5VSD8 79 aa3.21□□□□□ -1.89
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RABGEF1-202ENST00000380828 M0QZ58 72 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1-202ENST00000380828 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
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RABGEF1-202ENST00000380828 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.15□□□□□ -1.91
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.86□□□□□ -1.95
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.8□□□□□ -1.96
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RABGEF1-202ENST00000380828 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.75□□□□□ -1.97
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP12-4P60329 112 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1-202ENST00000380828 SSPOA2VEC9 5147 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1-202ENST00000380828 MT1FP04733 61 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.41□□□□□ -2.02
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