RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.78□□□□□ -0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 BSNQ9UPA5 3926 aa9.65□□□□□ -0.86
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS13CQ709C8 3753 aa9.65□□□□□ -0.87
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.57□□□□□ -0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.57□□□□□ -0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.56□□□□□ -0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAH2Q9P225 4427 aa9.55□□□□□ -0.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.53□□□□□ -0.88
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GNPTAB-201ENST00000299314 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.47□□□□□ -0.89
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GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP9Q99996 3911 aa9.35□□□□□ -0.91
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GNPTAB-201ENST00000299314 SACSQ9NZJ4 4579 aa9□□□□□ -0.97
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GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.65□□□□□ -1.02
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.62□□□□□ -1.03
GNPTAB-201ENST00000299314 RYR1P21817 5038 aa8.62□□□□□ -1.03
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE3BQ5TA77 95 aa8.55□□□□□ -1.04
GNPTAB-201ENST00000299314 MT1XP80297 61 aa8.53□□□□□ -1.04
GNPTAB-201ENST00000299314 DNHD1Q96M86 4753 aa8.52□□□□□ -1.04
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.52□□□□□ -1.05
GNPTAB-201ENST00000299314 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.51□□□□□ -1.05
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GNPTAB-201ENST00000299314 MT1GP13640 62 aa8.43□□□□□ -1.06
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GNPTAB-201ENST00000299314 SPRR2BP35325 72 aa8.43□□□□□ -1.06
GNPTAB-201ENST00000299314 SPRR2AP35326 72 aa8.43□□□□□ -1.06
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.42□□□□□ -1.06
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GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.2□□□□□ -1.1
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.2□□□□□ -1.1
GNPTAB-201ENST00000299314 SPRR2DP22532 72 aa8.15□□□□□ -1.1
GNPTAB-201ENST00000299314 LYSTQ99698 3801 aa8.14□□□□□ -1.11
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GNPTAB-201ENST00000299314 MYCBP2O75592 4640 aa8.11□□□□□ -1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE3DQ9BYE3 92 aa8.1□□□□□ -1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HERC1Q15751 4861 aa8.09□□□□□ -1.11
GNPTAB-201ENST00000299314 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.03□□□□□ -1.12
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.03□□□□□ -1.12
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPG2P98160 4391 aa8.01□□□□□ -1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RYR2Q92736 4967 aa7.98□□□□□ -1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE2CQ5TA81 110 aa7.96□□□□□ -1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.83□□□□□ -1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PKD1P98161 4303 aa7.82□□□□□ -1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.8□□□□□ -1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 MT1LQ93083 61 aa7.78□□□□□ -1.16
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.74□□□□□ -1.17
GNPTAB-201ENST00000299314 MT1EP04732 61 aa7.68□□□□□ -1.18
GNPTAB-201ENST00000299314 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.64□□□□□ -1.19
GNPTAB-201ENST00000299314 LPAP08519 4548 aa7.52□□□□□ -1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 LRP2P98164 4655 aa7.51□□□□□ -1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.5□□□□□ -1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 HERC2O95714 4834 aa7.48□□□□□ -1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 PRM1P04553 51 aa7.48□□□□□ -1.21
GNPTAB-201ENST00000299314 MT1MQ8N339 61 aa7.46□□□□□ -1.22
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.41□□□□□ -1.22
GNPTAB-201ENST00000299314 MT3P25713 68 aa7.39□□□□□ -1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.37□□□□□ -1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TNXBP22105 4242 aa7.34□□□□□ -1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.33□□□□□ -1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-201ENST00000299314 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-201ENST00000299314 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-201ENST00000299314 PKHD1P08F94 4074 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC17Q685J3 4493 aa7.23□□□□□ -1.25
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