RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 VPS13CQ709C8 3753 aa8.65□□□□□ -1.02
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.64□□□□□ -1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.53□□□□□ -1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.52□□□□□ -1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.52□□□□□ -1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.5□□□□□ -1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-5P60370 271 aa8.46□□□□□ -1.06
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP9Q99996 3911 aa8.45□□□□□ -1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.41□□□□□ -1.06
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.4□□□□□ -1.06
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.4□□□□□ -1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MT1HP80294 61 aa8.38□□□□□ -1.07
CCSAP-201ENST00000284617 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.37□□□□□ -1.07
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH2Q9P225 4427 aa8.36□□□□□ -1.07
CCSAP-201ENST00000284617 MT2AP02795 61 aa8.33□□□□□ -1.08
CCSAP-201ENST00000284617 FAT1Q14517 4588 aa8.3□□□□□ -1.08
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.24□□□□□ -1.09
CCSAP-201ENST00000284617 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.19□□□□□ -1.1
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MT1FP04733 61 aa8.13□□□□□ -1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.06□□□□□ -1.12
CCSAP-201ENST00000284617 DNHD1Q96M86 4753 aa8.04□□□□□ -1.12
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.04□□□□□ -1.12
CCSAP-201ENST00000284617 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.04□□□□□ -1.12
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.02□□□□□ -1.13
CCSAP-201ENST00000284617 LCE3CQ5T5A8 94 aa8□□□□□ -1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.99□□□□□ -1.13
CCSAP-201ENST00000284617 RYR1P21817 5038 aa7.98□□□□□ -1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCSAP-201ENST00000284617 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.86□□□□□ -1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.85□□□□□ -1.15
CCSAP-201ENST00000284617 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.82□□□□□ -1.16
CCSAP-201ENST00000284617 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.79□□□□□ -1.16
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.78□□□□□ -1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.75□□□□□ -1.17
CCSAP-201ENST00000284617 ANK2Q01484 3957 aa7.72□□□□□ -1.17
CCSAP-201ENST00000284617 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CCSAP-201ENST00000284617 RYR3Q15413 4870 aa7.55□□□□□ -1.2
CCSAP-201ENST00000284617 MT1XP80297 61 aa7.55□□□□□ -1.2
CCSAP-201ENST00000284617 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCSAP-201ENST00000284617 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.51□□□□□ -1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MYCBP2O75592 4640 aa7.5□□□□□ -1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KMT2AQ03164 3969 aa7.48□□□□□ -1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.47□□□□□ -1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MT1BP07438 61 aa7.46□□□□□ -1.22
CCSAP-201ENST00000284617 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.46□□□□□ -1.22
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.45□□□□□ -1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.44□□□□□ -1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.43□□□□□ -1.22
CCSAP-201ENST00000284617 RYR2Q92736 4967 aa7.38□□□□□ -1.23
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.37□□□□□ -1.23
CCSAP-201ENST00000284617 LYSTQ99698 3801 aa7.32□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 LCE3BQ5TA77 95 aa7.31□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.3□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR2EP22531 72 aa7.29□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR2BP35325 72 aa7.29□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR2AP35326 72 aa7.29□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP12-4P60329 112 aa7.29□□□□□ -1.24
CCSAP-201ENST00000284617 MT1GP13640 62 aa7.27□□□□□ -1.25
CCSAP-201ENST00000284617 HERC1Q15751 4861 aa7.22□□□□□ -1.25
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.22□□□□□ -1.25
CCSAP-201ENST00000284617 LCE2CQ5TA81 110 aa7.21□□□□□ -1.25
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.21□□□□□ -1.25
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.18□□□□□ -1.26
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.18□□□□□ -1.26
CCSAP-201ENST00000284617 HSPG2P98160 4391 aa7.15□□□□□ -1.26
CCSAP-201ENST00000284617 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.14□□□□□ -1.27
CCSAP-201ENST00000284617 LCE2BO14633 110 aa7.1□□□□□ -1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PKD1P98161 4303 aa7.09□□□□□ -1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR2DP22532 72 aa7.07□□□□□ -1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.06□□□□□ -1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.03□□□□□ -1.28
CCSAP-201ENST00000284617 HERC2O95714 4834 aa7.02□□□□□ -1.28
CCSAP-201ENST00000284617 HYDINQ4G0P3 5121 aa7□□□□□ -1.29
CCSAP-201ENST00000284617 LRP2P98164 4655 aa6.98□□□□□ -1.29
CCSAP-201ENST00000284617 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.95□□□□□ -1.3
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.92□□□□□ -1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.91□□□□□ -1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MT1LQ93083 61 aa6.9□□□□□ -1.31
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.86□□□□□ -1.31
CCSAP-201ENST00000284617 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.83□□□□□ -1.32
CCSAP-201ENST00000284617 MT1EP04732 61 aa6.82□□□□□ -1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PKHD1P08F94 4074 aa6.81□□□□□ -1.32
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.79□□□□□ -1.32
CCSAP-201ENST00000284617 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.72□□□□□ -1.33
CCSAP-201ENST00000284617 MUC17Q685J3 4493 aa6.68□□□□□ -1.34
CCSAP-201ENST00000284617 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCSAP-201ENST00000284617 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCSAP-201ENST00000284617 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCSAP-201ENST00000284617 MT1MQ8N339 61 aa6.6□□□□□ -1.35
CCSAP-201ENST00000284617 LPAP08519 4548 aa6.57□□□□□ -1.36
CCSAP-201ENST00000284617 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCSAP-201ENST00000284617 MT3P25713 68 aa6.52□□□□□ -1.37
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.51□□□□□ -1.37
CCSAP-201ENST00000284617 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms