RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 A0A1B0GVY2 172 aa5.56□□□□□ -1.52
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.53□□□□□ -1.52
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.49□□□□□ -1.53
ZBED4-201ENST00000216268 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.43□□□□□ -1.54
ZBED4-201ENST00000216268 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.42□□□□□ -1.54
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.39□□□□□ -1.55
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ZBED4-201ENST00000216268 FAT1Q14517 4588 aa5.36□□□□□ -1.55
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.34□□□□□ -1.55
ZBED4-201ENST00000216268 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.3□□□□□ -1.56
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.29□□□□□ -1.56
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ZBED4-201ENST00000216268 PKHD1P08F94 4074 aa5.28□□□□□ -1.56
ZBED4-201ENST00000216268 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.28□□□□□ -1.56
ZBED4-201ENST00000216268 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
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ZBED4-201ENST00000216268 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.14□□□□□ -1.59
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP10-12P60413 245 aa4.92□□□□□ -1.62
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ZBED4-201ENST00000216268 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.3□□□□□ -1.72
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ZBED4-201ENST00000216268 MT1FP04733 61 aa4.28□□□□□ -1.72
ZBED4-201ENST00000216268 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.26□□□□□ -1.73
ZBED4-201ENST00000216268 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.24□□□□□ -1.73
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.22□□□□□ -1.73
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.22□□□□□ -1.73
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.2□□□□□ -1.74
ZBED4-201ENST00000216268 LCE2CQ5TA81 110 aa4.19□□□□□ -1.74
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP12-4P60329 112 aa4.15□□□□□ -1.74
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.11□□□□□ -1.75
ZBED4-201ENST00000216268 MUC17Q685J3 4493 aa4.1□□□□□ -1.75
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.09□□□□□ -1.76
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ZBED4-201ENST00000216268 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.07□□□□□ -1.76
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.92□□□□□ -1.78
ZBED4-201ENST00000216268 LCE3BQ5TA77 95 aa3.9□□□□□ -1.78
ZBED4-201ENST00000216268 LCE2BO14633 110 aa3.89□□□□□ -1.79
ZBED4-201ENST00000216268 MT1XP80297 61 aa3.88□□□□□ -1.79
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.86□□□□□ -1.79
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.86□□□□□ -1.79
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ZBED4-201ENST00000216268 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.85□□□□□ -1.79
ZBED4-201ENST00000216268 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.84□□□□□ -1.8
ZBED4-201ENST00000216268 USH2AO75445 5202 aa3.81□□□□□ -1.8
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.79□□□□□ -1.8
ZBED4-201ENST00000216268 MT1GP13640 62 aa3.76□□□□□ -1.81
ZBED4-201ENST00000216268 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
ZBED4-201ENST00000216268 PRM1P04553 51 aa3.73□□□□□ -1.81
ZBED4-201ENST00000216268 KMT2DO14686 5537 aa3.69□□□□□ -1.82
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.62□□□□□ -1.83
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.6□□□□□ -1.83
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