RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.36■□□□□ 0.69
ZBED4-201ENST00000216268 MYT1Q01538 1121 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED4-201ENST00000216268 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ZBED4-201ENST00000216268 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.63■□□□□ 0.57
ZBED4-201ENST00000216268 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZBED4-201ENST00000216268 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED4-201ENST00000216268 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.85■□□□□ 0.45
ZBED4-201ENST00000216268 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ZBED4-201ENST00000216268 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
ZBED4-201ENST00000216268 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
ZBED4-201ENST00000216268 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.59■□□□□ 0.41
ZBED4-201ENST00000216268 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ZBED4-201ENST00000216268 HRCP23327 699 aa17.33■□□□□ 0.36
ZBED4-201ENST00000216268 NEFLP07196 543 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED4-201ENST00000216268 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
ZBED4-201ENST00000216268 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.91■□□□□ 0.3
ZBED4-201ENST00000216268 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
ZBED4-201ENST00000216268 APLP2Q06481 763 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED4-201ENST00000216268 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ABCC9O60706 1549 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED4-201ENST00000216268 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
ZBED4-201ENST00000216268 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.56■□□□□ 0.24
ZBED4-201ENST00000216268 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ZBED4-201ENST00000216268 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
ZBED4-201ENST00000216268 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ZBED4-201ENST00000216268 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED4-201ENST00000216268 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ZBED4-201ENST00000216268 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ZBED4-201ENST00000216268 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
ZBED4-201ENST00000216268 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
ZBED4-201ENST00000216268 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.24■□□□□ 0.19
ZBED4-201ENST00000216268 BCL11AQ9H165 835 aa16.22■□□□□ 0.19
ZBED4-201ENST00000216268 BCANQ96GW7 911 aa16.21■□□□□ 0.18
ZBED4-201ENST00000216268 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM41Q8WV44 630 aa16.16■□□□□ 0.18
ZBED4-201ENST00000216268 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.13■□□□□ 0.17
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.09■□□□□ 0.17
ZBED4-201ENST00000216268 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ZBED4-201ENST00000216268 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ZBED4-201ENST00000216268 SCRIBQ14160 1630 aa16.02■□□□□ 0.16
ZBED4-201ENST00000216268 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ZBED4-201ENST00000216268 NEUROD1Q13562 356 aa15.98■□□□□ 0.15
ZBED4-201ENST00000216268 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.94■□□□□ 0.14
ZBED4-201ENST00000216268 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.93■□□□□ 0.14
ZBED4-201ENST00000216268 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ZBED4-201ENST00000216268 NBR1Q14596 966 aa15.83■□□□□ 0.13
ZBED4-201ENST00000216268 FKBP8Q14318 412 aa15.77■□□□□ 0.12
ZBED4-201ENST00000216268 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
ZBED4-201ENST00000216268 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
ZBED4-201ENST00000216268 ANP32CO43423 234 aa15.72■□□□□ 0.11
ZBED4-201ENST00000216268 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
ZBED4-201ENST00000216268 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
ZBED4-201ENST00000216268 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
ZBED4-201ENST00000216268 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
ZBED4-201ENST00000216268 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.64■□□□□ 0.09
ZBED4-201ENST00000216268 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED4-201ENST00000216268 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ZBED4-201ENST00000216268 ITGAEP38570 1179 aa15.52■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.51■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 NEFMP07197 916 aa15.47■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.46■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.46■□□□□ 0.07
ZBED4-201ENST00000216268 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ZBED4-201ENST00000216268 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
ZBED4-201ENST00000216268 NACADO15069 1562 aa15.42■□□□□ 0.06
ZBED4-201ENST00000216268 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.42■□□□□ 0.06
ZBED4-201ENST00000216268 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.39■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 ARXQ96QS3 562 aa15.36■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
ZBED4-201ENST00000216268 MIER1Q8N108 512 aa15.33■□□□□ 0.04
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.32■□□□□ 0.04
ZBED4-201ENST00000216268 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
ZBED4-201ENST00000216268 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ZBED4-201ENST00000216268 SLC24A1O60721 1099 aa15.28■□□□□ 0.04
ZBED4-201ENST00000216268 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
ZBED4-201ENST00000216268 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
ZBED4-201ENST00000216268 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 BECN1Q14457 450 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 FBLN2P98095 1184 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM52Q96A61 297 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 P3H3Q8IVL6 736 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED4-201ENST00000216268 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED4-201ENST00000216268 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ZBED4-201ENST00000216268 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ZBED4-201ENST00000216268 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms