RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.03□□□□□ -0.96
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KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 P0C880 135 aa8.96□□□□□ -0.98
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KCNQ1-201ENST00000155840 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ROMO1P60602 79 aa8.91□□□□□ -0.98
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KCNQ1-201ENST00000155840 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
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KCNQ1-201ENST00000155840 Q5VSD8 79 aa8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 LRP2P98164 4655 aa8.83□□□□□ -1
KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-201ENST00000155840 TPRXLQ17RH7 258 aa8.81□□□□□ -1
KCNQ1-201ENST00000155840 XP32Q5T750 250 aa8.81□□□□□ -1
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KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP12-2P59991 146 aa8.75□□□□□ -1.01
KCNQ1-201ENST00000155840 TNXBP22105 4242 aa8.73□□□□□ -1.01
KCNQ1-201ENST00000155840 RYR1P21817 5038 aa8.72□□□□□ -1.01
KCNQ1-201ENST00000155840 RYR3Q15413 4870 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.57□□□□□ -1.04
KCNQ1-201ENST00000155840 NDUFAF8A1L188 74 aa8.56□□□□□ -1.04
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP12-1P59990 96 aa8.53□□□□□ -1.04
KCNQ1-201ENST00000155840 M0QZ58 72 aa8.49□□□□□ -1.05
KCNQ1-201ENST00000155840 MT1HL1P0DM35 61 aa8.43□□□□□ -1.06
KCNQ1-201ENST00000155840 MUC2Q02817 5179 aa8.43□□□□□ -1.06
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KCNQ1-201ENST00000155840 R4GN34 69 aa8.39□□□□□ -1.07
KCNQ1-201ENST00000155840 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.35□□□□□ -1.07
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.26□□□□□ -1.09
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.13□□□□□ -1.11
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.11□□□□□ -1.11
KCNQ1-201ENST00000155840 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.1□□□□□ -1.11
KCNQ1-201ENST00000155840 J3QL48 77 aa8.07□□□□□ -1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 PLAC4Q8WY50 150 aa7.98□□□□□ -1.13
KCNQ1-201ENST00000155840 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.96□□□□□ -1.13
KCNQ1-201ENST00000155840 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
KCNQ1-201ENST00000155840 HERC2O95714 4834 aa7.96□□□□□ -1.14
KCNQ1-201ENST00000155840 MUC17Q685J3 4493 aa7.95□□□□□ -1.14
KCNQ1-201ENST00000155840 HERC1Q15751 4861 aa7.83□□□□□ -1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.81□□□□□ -1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF213Q63HN8 5207 aa7.78□□□□□ -1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 LUZP6Q538Z0 58 aa7.72□□□□□ -1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 M0R2T5 61 aa7.61□□□□□ -1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.61□□□□□ -1.19
KCNQ1-201ENST00000155840 TNP1P09430 55 aa7.56□□□□□ -1.2
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KCNQ1-201ENST00000155840 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.47□□□□□ -1.21
KCNQ1-201ENST00000155840 PP632Q6XCG6 107 aa7.45□□□□□ -1.22
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KCNQ1-201ENST00000155840 A0A0A0MQY5 61 aa7.34□□□□□ -1.23
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP10-10P60014 251 aa7.3□□□□□ -1.24
KCNQ1-201ENST00000155840 LCE3AQ5TA76 89 aa7.27□□□□□ -1.25
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.21□□□□□ -1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 LCE2CQ5TA81 110 aa7.2□□□□□ -1.26
KCNQ1-201ENST00000155840 MT1FP04733 61 aa7.12□□□□□ -1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 USH2AO75445 5202 aa7.11□□□□□ -1.27
KCNQ1-201ENST00000155840 MT1HP80294 61 aa7.08□□□□□ -1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 KMT2DO14686 5537 aa7.07□□□□□ -1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.05□□□□□ -1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 MT2AP02795 61 aa7.03□□□□□ -1.28
KCNQ1-201ENST00000155840 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.94□□□□□ -1.3
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.88□□□□□ -1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.84□□□□□ -1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP10-5P60370 271 aa6.82□□□□□ -1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP12-3P60328 96 aa6.82□□□□□ -1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 MT1XP80297 61 aa6.81□□□□□ -1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP10-12P60413 245 aa6.81□□□□□ -1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 MT1BP07438 61 aa6.8□□□□□ -1.32
KCNQ1-201ENST00000155840 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.77□□□□□ -1.33
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.71□□□□□ -1.34
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.62□□□□□ -1.35
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.59□□□□□ -1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.59□□□□□ -1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.55□□□□□ -1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.54□□□□□ -1.36
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.48□□□□□ -1.37
KCNQ1-201ENST00000155840 LCE2BO14633 110 aa6.44□□□□□ -1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.44□□□□□ -1.38
KCNQ1-201ENST00000155840 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.33□□□□□ -1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.31□□□□□ -1.4
KCNQ1-201ENST00000155840 INE1O15225 51 aa6.27□□□□□ -1.41
KCNQ1-201ENST00000155840 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1-201ENST00000155840 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1-201ENST00000155840 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1-201ENST00000155840 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.06□□□□□ -1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.05□□□□□ -1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 SSPOA2VEC9 5147 aa6.04□□□□□ -1.44
KCNQ1-201ENST00000155840 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.01□□□□□ -1.45
KCNQ1-201ENST00000155840 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.01□□□□□ -1.45
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