RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
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PTPRJ-207ENST00000613246 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP10-12P60413 245 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP10-5P60370 271 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 LCE3AQ5TA76 89 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRJ-207ENST00000613246 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRJ-207ENST00000613246 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.74□□□□□ -1.17
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