RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 C8orf87E5RJ46 101 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 C14orf177Q52M58 125 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 DNAH2Q9P225 4427 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 Q96NJ1 140 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GVX0 72 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 A0A087X002 238 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 FBN3Q75N90 2809 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 TGP01266 2768 aa8.06□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 NUPR2A6NF83 97 aa8.05□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 ACYP2P14621 99 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 DNHD1Q96M86 4753 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 Q5W150 140 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.03□□□□□ -1.12
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GU69 56 aa8.02□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WTM6 91 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 LINC01554Q52M75 96 aa8□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 RTL8CO15255 209 aa7.96□□□□□ -1.13
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 H3BS24 57 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.91□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 UQCR11O14957 56 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-212ENST00000488380 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 LINC00483Q53H64 154 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 DMAC1Q96GE9 116 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 CSAG1Q6PB30 78 aa7.87□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 ZNF861PO60384 105 aa7.84□□□□□ -1.15
NISCH-212ENST00000488380 LY6G6CO95867 125 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.83□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 FAM229AH3BQW9 127 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2-30P06310 120 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-2P60368 255 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 SPINK1P00995 79 aa7.78□□□□□ -1.16
NISCH-212ENST00000488380 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-212ENST00000488380 IGLV7-43P04211 117 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-212ENST00000488380 PKD1P98161 4303 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-212ENST00000488380 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-212ENST00000488380 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.68□□□□□ -1.18
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-1P60331 282 aa7.67□□□□□ -1.18
NISCH-212ENST00000488380 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-212ENST00000488380 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-212ENST00000488380 Q8N1X5 172 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-212ENST00000488380 PKHD1P08F94 4074 aa7.63□□□□□ -1.19
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZSA8 131 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-212ENST00000488380 CRIPTQ9P021 101 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 H0YAA0 97 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 A8MUU9 505 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 ROMO1P60602 79 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GU33 70 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-212ENST00000488380 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NISCH-212ENST00000488380 FAT1Q14517 4588 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-212ENST00000488380 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
NISCH-212ENST00000488380 K7ERS5 55 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-212ENST00000488380 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NISCH-212ENST00000488380 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-212ENST00000488380 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NISCH-212ENST00000488380 C9orf92A6NGG3 77 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-212ENST00000488380 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-212ENST00000488380 P0C880 135 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 RYR2Q92736 4967 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GVY2 172 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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