RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436759.6

PLEC-208, Transcript of plectin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEC, Length 14,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-208ENST00000436759 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.86□□□□□ -1.31
PLEC-208ENST00000436759 TNP1P09430 55 aa6.86□□□□□ -1.31
PLEC-208ENST00000436759 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.85□□□□□ -1.31
PLEC-208ENST00000436759 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.84□□□□□ -1.31
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.83□□□□□ -1.32
PLEC-208ENST00000436759 HTTP42858 3142 aa6.81□□□□□ -1.32
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP10-2P60368 255 aa6.79□□□□□ -1.32
PLEC-208ENST00000436759 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.78□□□□□ -1.32
PLEC-208ENST00000436759 TENM4Q6N022 2769 aa6.77□□□□□ -1.33
PLEC-208ENST00000436759 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PLEC-208ENST00000436759 ATMQ13315 3056 aa6.72□□□□□ -1.33
PLEC-208ENST00000436759 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.71□□□□□ -1.34
PLEC-208ENST00000436759 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.68□□□□□ -1.34
PLEC-208ENST00000436759 ZANQ9Y493 2812 aa6.66□□□□□ -1.34
PLEC-208ENST00000436759 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PLEC-208ENST00000436759 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.64□□□□□ -1.35
PLEC-208ENST00000436759 P0C880 135 aa6.63□□□□□ -1.35
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PLEC-208ENST00000436759 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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PLEC-208ENST00000436759 TGP01266 2768 aa6.58□□□□□ -1.36
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.56□□□□□ -1.36
PLEC-208ENST00000436759 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PLEC-208ENST00000436759 H0YAA0 97 aa6.52□□□□□ -1.37
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.5□□□□□ -1.37
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.5□□□□□ -1.37
PLEC-208ENST00000436759 VWFP04275 2813 aa6.49□□□□□ -1.37
PLEC-208ENST00000436759 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.49□□□□□ -1.37
PLEC-208ENST00000436759 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.48□□□□□ -1.37
PLEC-208ENST00000436759 COL6A3P12111 3177 aa6.41□□□□□ -1.38
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP10-8P60410 259 aa6.41□□□□□ -1.38
PLEC-208ENST00000436759 UTRNP46939 3433 aa6.36□□□□□ -1.39
PLEC-208ENST00000436759 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.36□□□□□ -1.39
PLEC-208ENST00000436759 COL7A1Q02388 2944 aa6.34□□□□□ -1.39
PLEC-208ENST00000436759 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.32□□□□□ -1.4
PLEC-208ENST00000436759 TENM2Q9NT68 2774 aa6.32□□□□□ -1.4
PLEC-208ENST00000436759 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.27□□□□□ -1.41
PLEC-208ENST00000436759 XP32Q5T750 250 aa6.22□□□□□ -1.41
PLEC-208ENST00000436759 TPRXLQ17RH7 258 aa6.14□□□□□ -1.43
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PLEC-208ENST00000436759 SPEGQ15772 3267 aa6.11□□□□□ -1.43
PLEC-208ENST00000436759 EYSQ5T1H1 3165 aa6.1□□□□□ -1.43
PLEC-208ENST00000436759 LAMA3Q16787 3333 aa6.09□□□□□ -1.43
PLEC-208ENST00000436759 A0A1B0GVY2 172 aa6.09□□□□□ -1.44
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.08□□□□□ -1.44
PLEC-208ENST00000436759 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.08□□□□□ -1.44
PLEC-208ENST00000436759 VCANP13611 3396 aa6.08□□□□□ -1.44
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP12-2P59991 146 aa6.04□□□□□ -1.44
PLEC-208ENST00000436759 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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PLEC-208ENST00000436759 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6□□□□□ -1.45
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PLEC-208ENST00000436759 FBN3Q75N90 2809 aa5.95□□□□□ -1.46
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP12-1P59990 96 aa5.93□□□□□ -1.46
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PLEC-208ENST00000436759 CDH23Q9H251 3354 aa5.9□□□□□ -1.47
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PLEC-208ENST00000436759 ZFHX3Q15911 3703 aa5.71□□□□□ -1.49
PLEC-208ENST00000436759 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.71□□□□□ -1.5
PLEC-208ENST00000436759 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.66□□□□□ -1.5
PLEC-208ENST00000436759 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.66□□□□□ -1.5
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PLEC-208ENST00000436759 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.63□□□□□ -1.51
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PLEC-208ENST00000436759 USP34Q70CQ2 3546 aa5.56□□□□□ -1.52
PLEC-208ENST00000436759 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.56□□□□□ -1.52
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.54□□□□□ -1.52
PLEC-208ENST00000436759 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.53□□□□□ -1.52
PLEC-208ENST00000436759 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.53□□□□□ -1.52
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PLEC-208ENST00000436759 KRTAP10-12P60413 245 aa5.44□□□□□ -1.54
PLEC-208ENST00000436759 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.37□□□□□ -1.55
PLEC-208ENST00000436759 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.35□□□□□ -1.55
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PLEC-208ENST00000436759 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.25□□□□□ -1.57
PLEC-208ENST00000436759 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.24□□□□□ -1.57
PLEC-208ENST00000436759 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.24□□□□□ -1.57
PLEC-208ENST00000436759 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
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PLEC-208ENST00000436759 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PLEC-208ENST00000436759 DNAH2Q9P225 4427 aa5.2□□□□□ -1.58
PLEC-208ENST00000436759 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.16□□□□□ -1.58
PLEC-208ENST00000436759 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.16□□□□□ -1.58
PLEC-208ENST00000436759 BSNQ9UPA5 3926 aa5.15□□□□□ -1.58
PLEC-208ENST00000436759 ANK2Q01484 3957 aa5.15□□□□□ -1.59
PLEC-208ENST00000436759 DMDP11532 3685 aa5.15□□□□□ -1.59
PLEC-208ENST00000436759 VPS13CQ709C8 3753 aa5.14□□□□□ -1.59
PLEC-208ENST00000436759 LCE3AQ5TA76 89 aa5.14□□□□□ -1.59
PLEC-208ENST00000436759 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.14□□□□□ -1.59
PLEC-208ENST00000436759 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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